More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0292 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 207 aa  424  1e-118  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  63.77 
 
 		 204 aa  254  4e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  47.64 
 
 		 206 aa  187  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  48.6 
 
 		 209 aa  180  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  46.57 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  44.81 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  45.28 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  43.87 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.98 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  45.58 
 
 		 209 aa  175  3e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 203 aa  175  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  42.92 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  44.81 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  47.2 
 
 		 206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  48.89 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  46.7 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  49.18 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 208 aa  171  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 202 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  41.04 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 203 aa  168  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  44.19 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 203 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  44.19 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 206 aa  167  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  45.62 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  46.76 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  46.11 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  43.87 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  43.4 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  42.92 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 203 aa  164  8e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  44.86 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  44.86 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  44.94 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  44.34 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  42.52 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  42.99 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  46.57 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 207 aa  161  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  46.88 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  45.81 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  46.11 
 
 		 208 aa  161  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 201 aa  161  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  44.94 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  160  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  40.87 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  48.33 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  40.48 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  42.31 
 
 		 200 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 205 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  43.93 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 201 aa  159  4e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  43.93 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  42.45 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  42.52 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 203 aa  157  9e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 201 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  46.26 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  42.38 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  42.38 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  42.38 
 
 		 205 aa  154  7e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  42.38 
 
 		 205 aa  154  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  41.9 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  42.38 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>