More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1226 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 224 aa  459  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  73.63 
 
 		 201 aa  319  3e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  68.97 
 
 		 203 aa  305  3e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  68.97 
 
 		 203 aa  303  1.0000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  69 
 
 		 203 aa  300  8.000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  67.98 
 
 		 203 aa  297  1e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  64.04 
 
 		 262 aa  277  1e-73  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  65.67 
 
 		 200 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  64.68 
 
 		 200 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  63.18 
 
 		 200 aa  264  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 200 aa  262  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 200 aa  262  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 200 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 200 aa  262  4e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 200 aa  262  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 200 aa  262  4e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  63.68 
 
 		 200 aa  262  4e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  63.18 
 
 		 200 aa  260  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  62.69 
 
 		 200 aa  258  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  62.69 
 
 		 200 aa  257  8e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  61.69 
 
 		 200 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  61.69 
 
 		 200 aa  256  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  59.7 
 
 		 200 aa  247  8e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  52.2 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  52.68 
 
 		 208 aa  215  5e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  197  7e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 201 aa  189  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 203 aa  188  5.999999999999999e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 206 aa  187  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 202 aa  187  8e-47  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 201 aa  187  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  45.89 
 
 		 206 aa  185  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 208 aa  185  6e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  47.62 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  47.62 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  45.41 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  46.86 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 208 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 205 aa  181  1e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  44.83 
 
 		 200 aa  180  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 205 aa  179  2.9999999999999997e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf682  ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000995603  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.23 
 
 		 211 aa  179  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 203 aa  177  8e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  45.71 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  44.28 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  46.67 
 
 		 208 aa  175  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  45.97 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  41.9 
 
 		 209 aa  173  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  45.02 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 203 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  172  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 201 aa  172  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 203 aa  172  5e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 208 aa  171  6.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  44.98 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  44.98 
 
 		 206 aa  171  7.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0343  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0236416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 203 aa  170  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>