More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1103 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  63.23 
 
 		 159 aa  192  2e-48  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  63.06 
 
 		 159 aa  189  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  62.58 
 
 		 159 aa  188  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  61.94 
 
 		 159 aa  186  2e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  52.27 
 
 		 172 aa  175  4e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  41.81 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  43.48 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  49.07 
 
 		 180 aa  132  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  42.86 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  43.29 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  42.86 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  42.86 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  48.54 
 
 		 185 aa  131  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  43.21 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  44.17 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  42.77 
 
 		 183 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  43.86 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  45.56 
 
 		 181 aa  124  1e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  40.94 
 
 		 184 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  45.68 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  46.36 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  41.57 
 
 		 181 aa  114  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  40.94 
 
 		 175 aa  114  7.999999999999999e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  42.76 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  39.88 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  43.42 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  39.19 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  39.33 
 
 		 173 aa  104  9e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  39.63 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  40.67 
 
 		 167 aa  97.8  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  40.79 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  41.18 
 
 		 189 aa  96.3  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  29.45 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  27.59 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  29.14 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  43.21 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  25.34 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  46.15 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  42.62 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  37.97 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  45.28 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  42.47 
 
 		 202 aa  53.5  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  45 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  34.35 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  46.43 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  43.64 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  54.72 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  38.75 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  51.02 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  48.98 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  52.4  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  45.9 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  45 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  37.5 
 
 		 206 aa  52.4  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 209 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  51.02 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05164  30S ribosomal subunit S4, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06980)  45.65 
 
 		 457 aa  52  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00412047  normal  0.822552 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  48.98 
 
 		 201 aa  52  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  45 
 
 		 206 aa  52  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  36.99 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  48.94 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  34.04 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  40.35 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 208 aa  51.6  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  44.9 
 
 		 202 aa  51.6  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  48.84 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  48.84 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>