More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01440 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  85.35 
 
 		 198 aa  349  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  75.76 
 
 		 197 aa  303  9.000000000000001e-82  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  78.05 
 
 		 208 aa  261  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  56.85 
 
 		 197 aa  226  1e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3968  ribosomal protein S4  51.76 
 
 		 195 aa  210  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  50.75 
 
 		 195 aa  206  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3640  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.05 
 
 		 198 aa  202  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883875  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  53.66 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  51.71 
 
 		 200 aa  193  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  58.02 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  52.22 
 
 		 200 aa  191  5e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  56.44 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  59.26 
 
 		 208 aa  187  8e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 209 aa  186  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  51.72 
 
 		 201 aa  184  9e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  49.01 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  50.99 
 
 		 201 aa  181  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  50.99 
 
 		 201 aa  181  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  57.67 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  48.8 
 
 		 209 aa  180  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  50.99 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  53.75 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  54.32 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  55.28 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  50.99 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 203 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  56.96 
 
 		 207 aa  179  2.9999999999999997e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 203 aa  178  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  60.37 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5056  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00247728  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  49.75 
 
 		 203 aa  178  4.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  43.54 
 
 		 203 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 200 aa  177  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  58.02 
 
 		 208 aa  178  5.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  177  7e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3885  30S ribosomal protein S4  53.94 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  53.75 
 
 		 207 aa  177  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  53.99 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 208 aa  176  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  53.75 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  49.5 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  54.94 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  53.75 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  54.94 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  54.94 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  54.88 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0650  ribosomal protein S4  52.73 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4525  30S ribosomal protein S4  52.73 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815516  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  53.94 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 200 aa  175  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  53.09 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  51.83 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  51.83 
 
 		 208 aa  176  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0507  30S ribosomal protein S4  52.12 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0478  30S ribosomal protein S4  52.12 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0511  30S ribosomal protein S4  52.12 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595592  normal  0.0197267 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  54.94 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>