More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0222 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  68.42 
 
 		 208 aa  298  5e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  63.64 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  64.59 
 
 		 208 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  62.2 
 
 		 208 aa  281  5.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  64.59 
 
 		 208 aa  278  5e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  62.2 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  62.2 
 
 		 209 aa  270  1e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  268  4e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 206 aa  267  8e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  66.03 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 208 aa  265  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  58.85 
 
 		 208 aa  265  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  58.37 
 
 		 209 aa  261  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 208 aa  261  6e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  64.11 
 
 		 208 aa  259  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  57.89 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 208 aa  258  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 208 aa  258  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 209 aa  254  5e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 209 aa  254  5e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  59.33 
 
 		 208 aa  254  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  58.85 
 
 		 208 aa  254  7e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  58.37 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 209 aa  251  4.0000000000000004e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0449  30S ribosomal protein S4  60.95 
 
 		 208 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010581  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  57.89 
 
 		 208 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 208 aa  250  9.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0252  RNA-binding S4 domain-containing protein  60.77 
 
 		 208 aa  248  4e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.94 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  56.67 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  57.89 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  56.46 
 
 		 208 aa  245  4e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  59.33 
 
 		 209 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 208 aa  244  8e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 209 aa  244  9e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  56.19 
 
 		 209 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  57.42 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 208 aa  241  5e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  58.57 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  56.67 
 
 		 207 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 208 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  56.19 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  58.1 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  58.1 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  58.1 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  56.67 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  58.1 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3272  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3292  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  58.57 
 
 		 206 aa  235  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  57.62 
 
 		 207 aa  235  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  56.67 
 
 		 207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  59.05 
 
 		 206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  58.57 
 
 		 206 aa  234  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0274  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0146675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0339  30S ribosomal protein S4  57.62 
 
 		 207 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.411098  normal  0.0560525 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  56.67 
 
 		 207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  58.57 
 
 		 206 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  56.67 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  56.67 
 
 		 207 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0523  ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645379  unclonable  0.0000000000198285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0353  ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 213 aa  232  3e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  58.1 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  58.1 
 
 		 206 aa  231  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  56.19 
 
 		 207 aa  232  4.0000000000000004e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3619  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 207 aa  231  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00390122  hitchhiker  0.00000000725029 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  58.1 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  58.1 
 
 		 206 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  55.71 
 
 		 207 aa  231  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>