More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0732 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 208 aa  423  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  68.27 
 
 		 208 aa  300  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  62.5 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  66.83 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  66.35 
 
 		 208 aa  290  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  64.42 
 
 		 208 aa  284  7e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  63.94 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  63.94 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  64.9 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  63.94 
 
 		 208 aa  283  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  63.94 
 
 		 208 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  64.11 
 
 		 209 aa  280  1e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  63.46 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  63.94 
 
 		 208 aa  278  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  60.58 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  62.5 
 
 		 208 aa  270  8.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  60.58 
 
 		 208 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 208 aa  265  5e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  61.54 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  59.33 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  57.21 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  57.69 
 
 		 208 aa  246  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 206 aa  242  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 206 aa  242  3e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 209 aa  242  3.9999999999999997e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  240  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 209 aa  237  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 209 aa  235  4e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 206 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  55.77 
 
 		 208 aa  234  6e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 209 aa  234  9e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 208 aa  234  9e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  234  9e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 209 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  56.94 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0449  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 208 aa  228  6e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010581  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 208 aa  224  6e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0353  ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0523  ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645379  unclonable  0.0000000000198285 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0252  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.29 
 
 		 208 aa  222  4e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 209 aa  220  9e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 208 aa  218  7e-56  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  52.4 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  207  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.29 
 
 		 211 aa  206  2e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3272  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 209 aa  204  5e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 209 aa  203  1e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  201  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  201  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  201  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 207 aa  201  9e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  201  9e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3292  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  201  9e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>