More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0871 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  100 
 
 		 208 aa  424  1e-118  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  63.46 
 
 		 208 aa  286  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  64.76 
 
 		 209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  62.68 
 
 		 209 aa  278  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 209 aa  277  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  62.68 
 
 		 206 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  60.1 
 
 		 208 aa  270  9e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  63.64 
 
 		 206 aa  270  1e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  64.11 
 
 		 206 aa  267  8e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  60.58 
 
 		 208 aa  266  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  64.11 
 
 		 206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  62.2 
 
 		 206 aa  265  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 206 aa  264  7e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 206 aa  264  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 206 aa  264  8e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 206 aa  264  8e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  264  8e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  60.1 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  262  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  262  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  263  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 208 aa  262  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0361  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000770574  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1830  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  261  4e-69  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00631907  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 208 aa  261  4.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 206 aa  261  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 206 aa  260  8.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  56.25 
 
 		 208 aa  260  8.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 208 aa  259  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  59.13 
 
 		 208 aa  259  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  58.17 
 
 		 208 aa  260  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  61.24 
 
 		 206 aa  259  2e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  62.2 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  61.72 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  62.68 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  57.89 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 206 aa  258  4e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  61.24 
 
 		 206 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0478  30S ribosomal protein S4  62.68 
 
 		 206 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000269214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0511  30S ribosomal protein S4  62.68 
 
 		 206 aa  258  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.595592  normal  0.0197267 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0343  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  257  7e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0236416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  58.85 
 
 		 209 aa  257  7e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0445  SSU ribosomal protein S4P  61.24 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.189793  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 206 aa  257  8e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 206 aa  257  9e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  59.81 
 
 		 206 aa  257  9e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  256  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3885  30S ribosomal protein S4  62.68 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0632608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0507  30S ribosomal protein S4  62.2 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0166592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  60.29 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  59.81 
 
 		 206 aa  256  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  60.77 
 
 		 206 aa  255  3e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  58.17 
 
 		 208 aa  255  3e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  59.33 
 
 		 206 aa  255  4e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  254  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4725  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.766159  normal  0.270309 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  58.37 
 
 		 206 aa  253  1.0000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  60.1 
 
 		 208 aa  253  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5056  30S ribosomal protein S4  61.72 
 
 		 206 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00247728  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  57.21 
 
 		 208 aa  252  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  252  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0650  ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.955539  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4525  30S ribosomal protein S4  61.24 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.815516  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  59.33 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  59.33 
 
 		 206 aa  251  6e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  249  1e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  59.13 
 
 		 208 aa  249  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  58.85 
 
 		 206 aa  250  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  58.17 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 206 aa  249  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 206 aa  249  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  249  3e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  59.52 
 
 		 207 aa  248  4e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>