More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0340 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  100 
 
 		 195 aa  398  9.999999999999999e-111  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3968  ribosomal protein S4  84.62 
 
 		 195 aa  350  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  52.02 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  50.75 
 
 		 197 aa  206  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  48.48 
 
 		 198 aa  204  6e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3640  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.27 
 
 		 198 aa  201  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000883875  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  50 
 
 		 197 aa  191  6e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  45.97 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 202 aa  177  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 201 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 206 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  46 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 208 aa  175  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45.07 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 200 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  44.5 
 
 		 209 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  50.93 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  53.16 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 203 aa  169  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  52.5 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 203 aa  167  6e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  167  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  51.55 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  167  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  44.08 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  43.54 
 
 		 209 aa  166  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  47.16 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  42.36 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  50.62 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  48.85 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  42.23 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  160  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  42.23 
 
 		 206 aa  160  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  48.75 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  43.2 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  50.93 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0075  ribosomal protein S4  48.47 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000794352 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.54 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  49.07 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>