More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3670 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  100 
 
 		 201 aa  408  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  83.58 
 
 		 201 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  83.58 
 
 		 201 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  83.58 
 
 		 201 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  81.59 
 
 		 201 aa  342  1e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  81.59 
 
 		 201 aa  342  1e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  80.6 
 
 		 201 aa  341  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  79.6 
 
 		 202 aa  337  8e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  80.6 
 
 		 201 aa  335  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  79.6 
 
 		 201 aa  333  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  73.63 
 
 		 201 aa  316  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  72.64 
 
 		 202 aa  313  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  69.65 
 
 		 202 aa  297  6e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 208 aa  262  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 208 aa  256  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  59.13 
 
 		 208 aa  251  7e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  58.17 
 
 		 208 aa  248  3e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  58.85 
 
 		 209 aa  241  5e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  240  7.999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  235  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 206 aa  197  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  197  9e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  51.92 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 201 aa  191  5e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  191  8e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  187  7e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 200 aa  187  9e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 203 aa  187  1e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  49.5 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  50.99 
 
 		 200 aa  185  3e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  185  3e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 203 aa  184  5e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 203 aa  184  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  51.96 
 
 		 204 aa  182  3e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 202 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  181  6e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  181  6e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  51.18 
 
 		 211 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>