More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4939 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  60.19 
 
 		 206 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  61.61 
 
 		 206 aa  248  4e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  60.19 
 
 		 206 aa  246  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  54.93 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  55.87 
 
 		 208 aa  225  4e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  54.72 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  56.48 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  56.48 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  56.48 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  56.48 
 
 		 206 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  56.48 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  219  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  56.48 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  56.48 
 
 		 206 aa  219  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  56.02 
 
 		 206 aa  218  5e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  54.21 
 
 		 206 aa  217  7.999999999999999e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  56.07 
 
 		 207 aa  217  7.999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  54.67 
 
 		 206 aa  216  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  54.93 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  54.63 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  54.25 
 
 		 208 aa  215  4e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  55.09 
 
 		 206 aa  214  5e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  55.09 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  54.63 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  53.77 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  54.63 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  54.63 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  54.63 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  54.63 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  54.72 
 
 		 208 aa  214  8e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  54.46 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  52.8 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  54.25 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  54.21 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  53.99 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  54.63 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  53.3 
 
 		 207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  51.17 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  54.21 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2301  ribosomal protein S4  51.63 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0792347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0779  30S ribosomal protein S4  50.7 
 
 		 209 aa  211  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  53.99 
 
 		 207 aa  211  5.999999999999999e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  51.89 
 
 		 207 aa  211  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 206 aa  211  9e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  54.93 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3272  30S ribosomal protein S4  53.77 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  52.78 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  51.42 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  53.05 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  52.78 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0482  SSU ribosomal protein S4P  52.56 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  53.24 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  52.36 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0449  30S ribosomal protein S4  54.93 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010581  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  208  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  51.89 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3924  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  52.36 
 
 		 208 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 207 aa  208  5e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0352  ribosomal protein S4  51.85 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.931615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  54.46 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  207  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  53.27 
 
 		 206 aa  208  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0343  30S ribosomal protein S4  52.31 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0236416  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  52.58 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  52.58 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  52.36 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  52.36 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  52.36 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>