More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_20600 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  73.13 
 
 		 201 aa  305  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 202 aa  304  5.0000000000000004e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 201 aa  301  5.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  69.65 
 
 		 201 aa  297  6e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  71.14 
 
 		 201 aa  296  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  71.14 
 
 		 201 aa  296  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 201 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 201 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 201 aa  293  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 201 aa  293  1e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  70.15 
 
 		 201 aa  290  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  68.16 
 
 		 202 aa  289  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  241  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  238  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  237  8e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  56.94 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  234  7e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 209 aa  228  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 209 aa  227  9e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  49.06 
 
 		 208 aa  193  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  190  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  188  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 208 aa  188  5e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 203 aa  187  8e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 203 aa  187  8e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  186  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  48.51 
 
 		 200 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  184  6e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 203 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 200 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  47.6 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 203 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  49.01 
 
 		 200 aa  181  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  47.55 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 202 aa  178  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  47.09 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 204 aa  177  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.12 
 
 		 208 aa  176  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  176  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 203 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  174  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 206 aa  174  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 201 aa  174  6e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 206 aa  174  7e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 197 aa  173  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  173  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 201 aa  173  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0343  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0236416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 211 aa  172  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>