More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0592 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  86.54 
 
 		 208 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  76.08 
 
 		 209 aa  323  1e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  76.44 
 
 		 208 aa  323  1e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  74.04 
 
 		 208 aa  322  2e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  74.04 
 
 		 208 aa  320  7e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  74.52 
 
 		 208 aa  315  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  72.25 
 
 		 209 aa  308  2.9999999999999997e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  69.71 
 
 		 208 aa  308  4e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  70.19 
 
 		 208 aa  308  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  71.29 
 
 		 209 aa  304  5.0000000000000004e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  64.42 
 
 		 201 aa  263  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  62.98 
 
 		 202 aa  260  1e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  64.42 
 
 		 202 aa  260  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 208 aa  255  4e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  60.58 
 
 		 208 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 206 aa  251  5.000000000000001e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 201 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 208 aa  248  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  59.13 
 
 		 201 aa  246  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  56.25 
 
 		 208 aa  245  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 202 aa  241  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  241  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 201 aa  240  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  241  7.999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  240  9e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  238  5e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  57.89 
 
 		 209 aa  237  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 201 aa  235  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  234  7e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  56.73 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  231  6e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 201 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 209 aa  230  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  229  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.81 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 208 aa  228  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 208 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 206 aa  225  4e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 208 aa  223  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0425  ribosomal protein S4  57.89 
 
 		 208 aa  221  4e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 209 aa  221  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0252  RNA-binding S4 domain-containing protein  57.69 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0523  ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645379  unclonable  0.0000000000198285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0353  ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 206 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 206 aa  217  8.999999999999998e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 209 aa  214  5.9999999999999996e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 209 aa  214  7e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  51.92 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  211  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 209 aa  207  7e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  54.07 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 209 aa  205  5e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  205  5e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  204  5e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  204  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  50.72 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>