More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2038 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 203 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  88.18 
 
 		 203 aa  385  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  84.73 
 
 		 203 aa  370  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  85.22 
 
 		 203 aa  369  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  84.24 
 
 		 203 aa  367  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  84.73 
 
 		 203 aa  369  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  84.24 
 
 		 203 aa  367  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 209 aa  218  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 208 aa  218  5e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  218  6e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  216  1e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  212  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  49.76 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 208 aa  207  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 201 aa  207  1e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 201 aa  205  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 201 aa  205  4e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 209 aa  204  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  52.71 
 
 		 201 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 209 aa  204  5e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  52.71 
 
 		 201 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  52.71 
 
 		 201 aa  205  5e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 208 aa  204  8e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  204  9e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 209 aa  204  9e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 208 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 206 aa  202  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  52.71 
 
 		 202 aa  203  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 208 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 201 aa  199  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  47.37 
 
 		 209 aa  199  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 206 aa  198  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 200 aa  198  5e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 208 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  198  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  197  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  48.34 
 
 		 208 aa  197  7e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  197  7e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 200 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  50.72 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  51.94 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 208 aa  195  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  195  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  45.93 
 
 		 208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 209 aa  194  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  46.31 
 
 		 200 aa  194  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 206 aa  194  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>