More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0763 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  56.13 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  55.66 
 
 		 209 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  55.66 
 
 		 209 aa  244  4.9999999999999997e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  56.13 
 
 		 209 aa  242  3e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  54.98 
 
 		 206 aa  235  3e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  53.55 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  54.98 
 
 		 208 aa  228  7e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  56.4 
 
 		 208 aa  227  9e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  55.45 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  51.18 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  55.92 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  55.45 
 
 		 208 aa  224  9e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  51.18 
 
 		 208 aa  223  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  51.18 
 
 		 208 aa  222  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  54.5 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  55.45 
 
 		 208 aa  221  4e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  52.36 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  52.61 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  50.71 
 
 		 208 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  52.61 
 
 		 206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  54.98 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  54.98 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  218  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  51.66 
 
 		 206 aa  215  5e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  51.64 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  50.71 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  55.19 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  51.89 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  51.18 
 
 		 208 aa  211  5.999999999999999e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  49.77 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  48.58 
 
 		 209 aa  209  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  51.66 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  47.87 
 
 		 208 aa  208  4e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 208 aa  207  8e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  48.34 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  48.82 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  49.29 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  47.87 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  54.5 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  48.82 
 
 		 208 aa  204  6e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 209 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  203  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  202  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  48.13 
 
 		 208 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  47.39 
 
 		 208 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  48.83 
 
 		 207 aa  201  9e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  47.87 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  49.77 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  51.89 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  50.71 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  48.83 
 
 		 207 aa  198  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  47.89 
 
 		 207 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  197  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  49.06 
 
 		 206 aa  197  7.999999999999999e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  47.89 
 
 		 207 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 206 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0274  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  197  9e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0146675 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  49.77 
 
 		 206 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  48.83 
 
 		 207 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 209 aa  197  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  47.64 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  46.7 
 
 		 206 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  48.36 
 
 		 207 aa  195  3e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  51.42 
 
 		 200 aa  195  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 206 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 206 aa  195  3e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  49.3 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 206 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  48.83 
 
 		 207 aa  195  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  46.95 
 
 		 213 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  47.42 
 
 		 207 aa  195  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 206 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>