More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0237 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  417  1e-116  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  77.88 
 
 		 208 aa  340  1e-92  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 203 aa  220  9e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  51.21 
 
 		 203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf682  ribosomal protein S4  52.94 
 
 		 200 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000995603  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  52.68 
 
 		 224 aa  215  5e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  52.94 
 
 		 200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  52.94 
 
 		 200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  52.45 
 
 		 200 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  51.94 
 
 		 203 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  51.94 
 
 		 202 aa  211  3.9999999999999995e-54  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  51.47 
 
 		 200 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  51.96 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  49.51 
 
 		 262 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  204  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 201 aa  204  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 200 aa  201  4e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 200 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  189  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 208 aa  190  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  49.05 
 
 		 208 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 207 aa  181  5.0000000000000004e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 208 aa  181  8.000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 203 aa  181  8.000000000000001e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  43.19 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 201 aa  178  4e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 207 aa  178  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 203 aa  178  5.999999999999999e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 203 aa  177  7e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 206 aa  178  7e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  45.67 
 
 		 206 aa  177  8e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  177  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  45.02 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 207 aa  176  2e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 209 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  44.98 
 
 		 208 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 203 aa  174  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 206 aa  174  8e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 206 aa  174  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3619  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00390122  hitchhiker  0.00000000725029 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 207 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0339  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 207 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.411098  normal  0.0560525 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 206 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2301  ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0792347  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  44.98 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  44.23 
 
 		 206 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>