More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1394 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  100 
 
 		 262 aa  535  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  75 
 
 		 203 aa  317  1e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  71.29 
 
 		 201 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  66.5 
 
 		 203 aa  280  2e-74  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  66.5 
 
 		 203 aa  278  4e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  66.5 
 
 		 203 aa  278  5e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  64.04 
 
 		 224 aa  277  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  65.35 
 
 		 200 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  65.35 
 
 		 200 aa  257  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  63.37 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  62.87 
 
 		 200 aa  254  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  62.87 
 
 		 200 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  62.87 
 
 		 200 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  62.87 
 
 		 200 aa  250  1e-65  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  63.73 
 
 		 200 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  52.43 
 
 		 208 aa  222  6e-57  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  52.66 
 
 		 205 aa  207  2e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  49.51 
 
 		 208 aa  207  2e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 200 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 205 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  51.42 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 201 aa  198  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 202 aa  198  7.999999999999999e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 201 aa  197  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  50.49 
 
 		 201 aa  194  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  52.61 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 201 aa  191  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 201 aa  190  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  50.71 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  48.79 
 
 		 206 aa  189  5.999999999999999e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  189  5.999999999999999e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  187  1e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  53.17 
 
 		 202 aa  186  4e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  48.34 
 
 		 208 aa  185  5e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  185  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 208 aa  184  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 201 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  49.53 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  50.73 
 
 		 202 aa  182  7e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  48.34 
 
 		 208 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.86 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 201 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  181  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 201 aa  180  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  47.87 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 206 aa  181  2e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  47.87 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 202 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  44.61 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 203 aa  180  2.9999999999999997e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  46.86 
 
 		 206 aa  179  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  179  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  179  5.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  178  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  178  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 206 aa  178  8e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  178  8e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 207 aa  178  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  178  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  48.04 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  50.73 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  50.73 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  48.82 
 
 		 206 aa  177  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  47.55 
 
 		 202 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>