More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0787 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  92.57 
 
 		 202 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1744  30S ribosomal protein S4  90.59 
 
 		 202 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  92.08 
 
 		 202 aa  385  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04611  30S ribosomal protein S4  90.59 
 
 		 202 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  90.1 
 
 		 202 aa  381  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  83.66 
 
 		 202 aa  355  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04711  30S ribosomal protein S4  85.15 
 
 		 202 aa  343  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22255  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0405  30S ribosomal protein S4  85.15 
 
 		 202 aa  342  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04291  30S ribosomal protein S4  84.65 
 
 		 202 aa  340  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04601  30S ribosomal protein S4  84.65 
 
 		 202 aa  340  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  74.63 
 
 		 202 aa  319  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  72.64 
 
 		 202 aa  317  5e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  73.13 
 
 		 202 aa  316  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  73.63 
 
 		 202 aa  316  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  73.13 
 
 		 202 aa  316  1e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  72.64 
 
 		 202 aa  314  6e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  74.51 
 
 		 204 aa  306  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  50.74 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  50.73 
 
 		 262 aa  182  4.0000000000000006e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 200 aa  174  7e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  46.6 
 
 		 206 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  46.04 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  171  5e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 203 aa  171  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 204 aa  171  6.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  171  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  169  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 203 aa  167  7e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 201 aa  167  7e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  44.06 
 
 		 200 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 201 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  44.71 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 206 aa  166  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 201 aa  165  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  165  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 203 aa  165  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 202 aa  165  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  164  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  46.63 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0834  ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 207 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>