More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2554 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  86.63 
 
 		 202 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  86.63 
 
 		 202 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  84.65 
 
 		 202 aa  358  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  81.19 
 
 		 202 aa  350  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  78.22 
 
 		 202 aa  347  5e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  78.61 
 
 		 202 aa  329  1e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  72.64 
 
 		 202 aa  314  6e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  69.15 
 
 		 202 aa  307  6.999999999999999e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1744  30S ribosomal protein S4  69.15 
 
 		 202 aa  305  3e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04611  30S ribosomal protein S4  68.66 
 
 		 202 aa  304  6e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  74.88 
 
 		 204 aa  304  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  68.66 
 
 		 202 aa  301  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  68.66 
 
 		 202 aa  300  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04711  30S ribosomal protein S4  70.15 
 
 		 202 aa  293  8e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22255  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04601  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 202 aa  293  1e-78  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04291  30S ribosomal protein S4  70.65 
 
 		 202 aa  293  1e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0405  30S ribosomal protein S4  70.15 
 
 		 202 aa  291  4e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  48.54 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 201 aa  175  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  51.23 
 
 		 203 aa  175  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  48.51 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  47.03 
 
 		 201 aa  174  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  49.04 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 204 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  49.27 
 
 		 262 aa  171  6.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  48.02 
 
 		 200 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  49.04 
 
 		 208 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 205 aa  169  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 201 aa  168  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  44.55 
 
 		 200 aa  168  5e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  48.76 
 
 		 201 aa  165  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  46.04 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.78 
 
 		 200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 202 aa  161  6e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 201 aa  160  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  47.14 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 203 aa  158  4e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  41.83 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  46.57 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 202 aa  157  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  42.36 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  45.71 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3798  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.108792  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  47.85 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  47.03 
 
 		 202 aa  157  1e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  46.92 
 
 		 211 aa  155  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  43.75 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  45.24 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3976  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>