More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4303 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  93.07 
 
 		 202 aa  384  1e-106  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  84.16 
 
 		 202 aa  361  5.0000000000000005e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  84.65 
 
 		 202 aa  358  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  83.17 
 
 		 202 aa  349  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  83.17 
 
 		 202 aa  349  1e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  81.09 
 
 		 202 aa  336  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  81.77 
 
 		 204 aa  323  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  73.63 
 
 		 202 aa  316  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  71.14 
 
 		 202 aa  312  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1744  30S ribosomal protein S4  69.65 
 
 		 202 aa  306  2.0000000000000002e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  71.14 
 
 		 202 aa  305  3e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04611  30S ribosomal protein S4  69.15 
 
 		 202 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  70.15 
 
 		 202 aa  304  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04711  30S ribosomal protein S4  68.16 
 
 		 202 aa  286  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04291  30S ribosomal protein S4  68.16 
 
 		 202 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04601  30S ribosomal protein S4  68.16 
 
 		 202 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0405  30S ribosomal protein S4  67.66 
 
 		 202 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  52.22 
 
 		 203 aa  183  2.0000000000000003e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 201 aa  181  7e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 201 aa  178  5.999999999999999e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 201 aa  175  5e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  47.57 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  48.04 
 
 		 262 aa  171  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 201 aa  170  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 205 aa  169  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 203 aa  168  5e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  47.6 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  45.54 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 201 aa  167  8e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  46.63 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.78 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 200 aa  166  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 204 aa  165  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  42.36 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 201 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  43.27 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  49.25 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  44.55 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 202 aa  159  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  158  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0779  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 209 aa  158  6e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 224 aa  158  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0429  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  43.54 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  43.07 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  47.26 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 207 aa  154  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>