More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_1744 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1744  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  414  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04611  30S ribosomal protein S4  99.01 
 
 		 202 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  90.59 
 
 		 202 aa  386  1e-106  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  90.59 
 
 		 202 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  89.11 
 
 		 202 aa  378  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  87.62 
 
 		 202 aa  375  1e-103  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0405  30S ribosomal protein S4  85.15 
 
 		 202 aa  347  5e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04291  30S ribosomal protein S4  85.15 
 
 		 202 aa  347  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04601  30S ribosomal protein S4  85.15 
 
 		 202 aa  347  6e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04711  30S ribosomal protein S4  85.15 
 
 		 202 aa  347  8e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22255  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  79.21 
 
 		 202 aa  341  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  70.15 
 
 		 202 aa  312  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  70.15 
 
 		 202 aa  309  2e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  69.65 
 
 		 202 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  68.66 
 
 		 202 aa  305  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  69.15 
 
 		 202 aa  305  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  68.66 
 
 		 202 aa  305  3e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  71.08 
 
 		 204 aa  296  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 203 aa  179  2.9999999999999997e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  46.53 
 
 		 203 aa  174  8e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 201 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  46.08 
 
 		 262 aa  171  9e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2145  ribosomal protein S4  45.89 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0738173  normal  0.592371 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 206 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 207 aa  169  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 205 aa  168  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 203 aa  167  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  45.05 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  165  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 205 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  164  9e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  47.12 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0834  ribosomal protein S4  43.54 
 
 		 207 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  44.06 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3891  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000651911  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0605  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000812639  normal  0.600341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0307  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  161  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000246284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  45.19 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04497  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 208 aa  161  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.777393  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  44.88 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  43.07 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  42.57 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  40.49 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  45.24 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0779  30S ribosomal protein S4  45.71 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0600575 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  44.55 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0347  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0772249  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 207 aa  157  8e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>