More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1004 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  81.77 
 
 		 202 aa  344  7e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  78.82 
 
 		 202 aa  337  7e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  77.45 
 
 		 202 aa  333  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  77.45 
 
 		 202 aa  333  9e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  77.94 
 
 		 202 aa  332  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  73.89 
 
 		 202 aa  325  3e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  74.88 
 
 		 202 aa  323  9e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  74.51 
 
 		 202 aa  320  7e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  72.06 
 
 		 202 aa  311  2.9999999999999996e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  71.57 
 
 		 202 aa  311  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1744  30S ribosomal protein S4  71.08 
 
 		 202 aa  311  5.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04611  30S ribosomal protein S4  70.59 
 
 		 202 aa  310  1e-83  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  73.04 
 
 		 202 aa  309  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04711  30S ribosomal protein S4  69.61 
 
 		 202 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.22255  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04291  30S ribosomal protein S4  69.12 
 
 		 202 aa  284  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04601  30S ribosomal protein S4  69.12 
 
 		 202 aa  284  7e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0405  30S ribosomal protein S4  68.63 
 
 		 202 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  47.78 
 
 		 203 aa  171  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  46.12 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.07 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  164  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  46.86 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  45.19 
 
 		 208 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  44.61 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 200 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  47.09 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  45.24 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 201 aa  159  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  45.93 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  47.37 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  44.23 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  44.29 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  45.5 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 201 aa  159  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  45.41 
 
 		 205 aa  158  4e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 206 aa  158  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  42.57 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 201 aa  158  6e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  46.89 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  42.58 
 
 		 209 aa  156  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  46.41 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  40.87 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  47.52 
 
 		 203 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  41.38 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 224 aa  154  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  47.34 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  41.75 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>