More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0874 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 205 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  64.39 
 
 		 203 aa  249  3e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 202 aa  179  4e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  48.77 
 
 		 202 aa  176  3e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  43.28 
 
 		 201 aa  174  9e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 202 aa  172  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04081  30S ribosomal protein S4  45.63 
 
 		 202 aa  171  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  41.09 
 
 		 201 aa  171  7.999999999999999e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21161  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 202 aa  169  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2554  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04611  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 202 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1744  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 202 aa  168  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  45.37 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 204 aa  167  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 206 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  44.17 
 
 		 202 aa  166  2e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 206 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  44.76 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.58 
 
 		 200 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  45.15 
 
 		 203 aa  164  6.9999999999999995e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 206 aa  164  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  43.41 
 
 		 205 aa  164  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  47.55 
 
 		 203 aa  164  9e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  42.03 
 
 		 205 aa  162  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  44.66 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 200 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 206 aa  161  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 203 aa  160  9e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 208 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  39.11 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  39.71 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  40.67 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 202 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  42.18 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 206 aa  158  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 206 aa  158  7e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 203 aa  158  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 201 aa  157  9e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  36.63 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  38.12 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  41.09 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  41.23 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 204 aa  154  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  43.27 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  40.49 
 
 		 205 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  41.15 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  41.46 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  41.46 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  41.46 
 
 		 206 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 205 aa  153  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  41.98 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  43.41 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  41.58 
 
 		 200 aa  153  2e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 205 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 201 aa  151  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  42.08 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>