More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf682 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf682  ribosomal protein S4  100 
 
 		 200 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000995603  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  52.94 
 
 		 208 aa  216  2e-55  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  54.5 
 
 		 202 aa  216  2e-55  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  51.71 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  48.06 
 
 		 206 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  49.75 
 
 		 200 aa  181  9.000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  48.04 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 224 aa  179  2e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 200 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 200 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  49.26 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  46.57 
 
 		 203 aa  175  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  44.88 
 
 		 202 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  46.08 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 205 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  45.32 
 
 		 203 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  45.97 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 208 aa  169  3e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 208 aa  169  4e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  46.8 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 209 aa  167  7e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  165  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 206 aa  165  5e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  46.31 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 202 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 201 aa  164  6.9999999999999995e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  45.89 
 
 		 262 aa  164  9e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  43.9 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  40.87 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  42.23 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.81 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  163  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 208 aa  162  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 201 aa  162  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  42.51 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  41.95 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 209 aa  159  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 201 aa  158  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  41.78 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  41.78 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  41.78 
 
 		 207 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  40.87 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  42.23 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  42.23 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  42.51 
 
 		 207 aa  157  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  40.87 
 
 		 208 aa  157  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  41.75 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  41.75 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  41.75 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  41.75 
 
 		 206 aa  157  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  39.9 
 
 		 208 aa  157  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  41.55 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  41.78 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0482  SSU ribosomal protein S4P  40.29 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  156  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  40.38 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  41.78 
 
 		 207 aa  156  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>