110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_77059 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  100 
 
 		 189 aa  382  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  77.84 
 
 		 193 aa  287  8e-77  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  79.65 
 
 		 193 aa  280  6.000000000000001e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  70 
 
 		 194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  64.07 
 
 		 167 aa  222  3e-57  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  43.12 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  41.72 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  41.88 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  41.98 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  40.76 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  35.76 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  40.85 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  41.94 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  39.51 
 
 		 177 aa  111  6e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  40.74 
 
 		 172 aa  111  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  39.49 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  36.72 
 
 		 178 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  38.89 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  35.59 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  40.13 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  37.74 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  35.8 
 
 		 184 aa  104  8e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  35.59 
 
 		 178 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  39.74 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  41.18 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  35.16 
 
 		 181 aa  93.6  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  37.72 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  37.95 
 
 		 182 aa  91.7  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  42.65 
 
 		 159 aa  88.2  7e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  40.44 
 
 		 159 aa  85.9  3e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  41.18 
 
 		 159 aa  86.3  3e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  39.04 
 
 		 159 aa  85.1  6e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  37.5 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  31.93 
 
 		 224 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  27.92 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  48.94 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  48.94 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  21.71 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  36.11 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  24.03 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  32.22 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  48.94 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1391  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.81 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  40.74 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  44.68 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  39.08 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  44.68 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.81 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  39.06 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  31.36 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  39.58 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  35.38 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  39.13 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  30.51 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  40.43 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  31.21 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  41.3 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  26.54 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  29.79 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0418  30S ribosomal protein S4  42.22 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0394  30S ribosomal protein S4  42.22 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4303  30S ribosomal protein S4  42.55 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000344205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  44.9 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  37.5 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  30.5 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  36.62 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  30.5 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  36.49 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  26.53 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0583  ribosomal protein S4  38.3 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  41.3 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  41.3 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  28.99 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  28.4 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3730  30S ribosomal protein S4  40.43 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.53592  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 208 aa  42.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  39.13 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  41.3 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  29.41 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  47.83 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  39.58 
 
 		 206 aa  42  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 202 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  36.07 
 
 		 208 aa  42  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.67 
 
 		 211 aa  42  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  47.83 
 
 		 197 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  32.39 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0324  30S ribosomal protein S4  38.3 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000000226614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  35.62 
 
 		 203 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>