34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29359 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  100 
 
 
183 aa  373  1e-103  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15757  predicted protein  49.72 
 
 
181 aa  199  1.9999999999999998e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319753  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  47.51 
 
 
183 aa  193  9e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  47.06 
 
 
188 aa  184  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  47.16 
 
 
196 aa  148  5e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  30.2 
 
 
172 aa  72.4  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  31.03 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  29.45 
 
 
181 aa  64.3  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  29.46 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  28.97 
 
 
173 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  26.67 
 
 
193 aa  60.5  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  23.29 
 
 
194 aa  57.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  30.52 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  25.5 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  25.31 
 
 
159 aa  51.6  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  27.81 
 
 
216 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  31.76 
 
 
173 aa  52  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  26.43 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  25.93 
 
 
159 aa  49.3  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  23.81 
 
 
187 aa  48.9  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  27.16 
 
 
178 aa  48.5  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  24.48 
 
 
159 aa  48.1  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  27.21 
 
 
175 aa  48.1  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  27.61 
 
 
178 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  25.74 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  25.9 
 
 
201 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  24.03 
 
 
189 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  27.44 
 
 
178 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  34.25 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  32.84 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  38.18 
 
 
180 aa  45.1  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  23.57 
 
 
181 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  27.27 
 
 
185 aa  42.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  24.69 
 
 
178 aa  42  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>