29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37810 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  100 
 
 		 183 aa  381  1e-105  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  56.15 
 
 		 188 aa  226  2e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  62.35 
 
 		 196 aa  224  7e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15757  predicted protein  55.8 
 
 		 181 aa  211  4.9999999999999996e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319753  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  47.51 
 
 		 183 aa  193  9e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  27.03 
 
 		 172 aa  67.4  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  25.85 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  25.34 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  24.26 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  33.66 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  33.67 
 
 		 159 aa  51.6  0.000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  24.03 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  20.29 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  29.7 
 
 		 159 aa  50.8  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  30.69 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  24.18 
 
 		 184 aa  48.5  0.00006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  24.03 
 
 		 167 aa  48.1  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  22.15 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  21.71 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  23.27 
 
 		 178 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  25 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  24.83 
 
 		 173 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  23.27 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  23.29 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  26.95 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  22.7 
 
 		 181 aa  41.2  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  21.05 
 
 		 216 aa  41.2  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  21.05 
 
 		 181 aa  41.2  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  24.16 
 
 		 173 aa  40.8  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>