79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02160 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  82.39 
 
 		 193 aa  306  1.0000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  76.17 
 
 		 189 aa  291  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  74.27 
 
 		 194 aa  262  3e-69  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  68.26 
 
 		 167 aa  234  4e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  43.41 
 
 		 183 aa  130  9e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  44.79 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  40 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  42.59 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  41.88 
 
 		 187 aa  120  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  43.33 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  41.94 
 
 		 173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  38.8 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  41.98 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  38.89 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  40.12 
 
 		 177 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  40 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  40.13 
 
 		 173 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  37.74 
 
 		 178 aa  106  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  39.38 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  38.22 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  36.48 
 
 		 178 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  37.11 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  36.48 
 
 		 178 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  39.87 
 
 		 175 aa  101  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  39.63 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  39.76 
 
 		 182 aa  95.9  3e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  41.18 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  33.68 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  42.65 
 
 		 159 aa  90.1  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  40.82 
 
 		 159 aa  88.2  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  39.58 
 
 		 159 aa  86.7  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  36.97 
 
 		 180 aa  84.3  9e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  29.46 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  24.03 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  24.2 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  37.5 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 209 aa  48.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  27.78 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  40.43 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  37.5 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  40.43 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  29.08 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0394  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0418  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  41.3 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  42.55 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  42.55 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  48.89 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  39.53 
 
 		 202 aa  42.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  45.65 
 
 		 209 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  42.22 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  47.73 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  38.89 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  42.55 
 
 		 208 aa  42.4  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  42.55 
 
 		 205 aa  42.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  42.55 
 
 		 206 aa  42  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  41.86 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  37.7 
 
 		 201 aa  42.4  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  33.78 
 
 		 208 aa  42  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  42.55 
 
 		 206 aa  42  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  38.3 
 
 		 201 aa  42  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 201 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  37.93 
 
 		 208 aa  42  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  24.26 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  36.17 
 
 		 204 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  40.48 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  40.48 
 
 		 197 aa  41.2  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  39.13 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>