More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2668 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 197 aa  406  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  98.98 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 200 aa  174  5e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  44.28 
 
 		 201 aa  169  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  45.67 
 
 		 206 aa  169  3e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  44.71 
 
 		 200 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  45.71 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  45.97 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  45.97 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 200 aa  167  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  45.24 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  46.57 
 
 		 202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  44.23 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 201 aa  161  5.0000000000000005e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 203 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  43.81 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 204 aa  160  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  44.06 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  42.23 
 
 		 206 aa  158  4e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  41.35 
 
 		 206 aa  157  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  43.07 
 
 		 203 aa  158  6e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  45.02 
 
 		 208 aa  157  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  43.06 
 
 		 206 aa  157  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  41.51 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  44.78 
 
 		 195 aa  157  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  43.93 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0743  ribosomal protein S4  41.78 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.068041  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  40.89 
 
 		 262 aa  155  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 205 aa  155  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3968  ribosomal protein S4  43.28 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  40.29 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  43.66 
 
 		 208 aa  155  4e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  42.38 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  42.57 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 224 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0075  ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000794352 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  43.19 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  41.58 
 
 		 201 aa  154  6e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  43.19 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0077  ribosomal protein S4  42.38 
 
 		 207 aa  154  7e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  43.66 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  43.19 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  43.19 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  49.69 
 
 		 208 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  39.81 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  43.07 
 
 		 203 aa  154  9e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  42.03 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0346  ribosomal protein S4  40.57 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000340936  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  41.83 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  42.23 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  40.89 
 
 		 201 aa  152  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  43.54 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  41.15 
 
 		 207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  39.11 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  40.67 
 
 		 207 aa  151  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  41.75 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  40.29 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  43.6 
 
 		 209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  42.03 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 209 aa  150  8e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2301  ribosomal protein S4  40.74 
 
 		 208 aa  150  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0792347  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  42.23 
 
 		 206 aa  150  8e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  39.71 
 
 		 207 aa  150  8.999999999999999e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0456  30S ribosomal protein S4  40.87 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.189833  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  47.2 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  41.75 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  41.09 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  44.29 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  150  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  39.62 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  41.63 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  41.15 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  39.71 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>