263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0421 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  89.6 
 
 
173 aa  320  5e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  70.76 
 
 
169 aa  240  7.999999999999999e-63  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  68.79 
 
 
173 aa  239  1e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  66.09 
 
 
175 aa  234  6e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  50.59 
 
 
177 aa  174  4e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  49.71 
 
 
187 aa  173  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  49.1 
 
 
178 aa  167  6e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  49.1 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  49.1 
 
 
178 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  45.83 
 
 
181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  49.1 
 
 
178 aa  160  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  44.38 
 
 
181 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  47.34 
 
 
183 aa  155  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  46.51 
 
 
216 aa  154  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  45.29 
 
 
181 aa  153  1e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  42.01 
 
 
185 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  42.6 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  41.18 
 
 
182 aa  142  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  47.44 
 
 
172 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  47.4 
 
 
181 aa  137  6e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  40.76 
 
 
193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  40 
 
 
193 aa  110  9e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  39.49 
 
 
189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  35.58 
 
 
201 aa  107  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.82 
 
 
194 aa  105  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  38.93 
 
 
181 aa  104  8e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  40.13 
 
 
180 aa  103  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  38.06 
 
 
167 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  41.73 
 
 
159 aa  94.7  6e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  38.58 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  39.2 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  39.2 
 
 
159 aa  88.2  5e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  34.26 
 
 
208 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  31.03 
 
 
183 aa  63.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  37.11 
 
 
206 aa  62  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  44.78 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  49.15 
 
 
203 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  28.39 
 
 
188 aa  58.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  31.65 
 
 
208 aa  57.8  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 
203 aa  56.2  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  43.59 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  52 
 
 
224 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  49.06 
 
 
206 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  38.96 
 
 
201 aa  55.1  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  50 
 
 
206 aa  55.1  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  49.06 
 
 
206 aa  54.7  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  33.76 
 
 
205 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  48.08 
 
 
209 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  42.37 
 
 
207 aa  52.8  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  36.11 
 
 
205 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 
205 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  40.68 
 
 
207 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  56.82 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  39.68 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5891  RNA-binding S4 domain protein  44.26 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  34.58 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 
203 aa  52.4  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  40.68 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 
205 aa  52  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  37.14 
 
 
208 aa  52.4  0.000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  50.85 
 
 
205 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  38.81 
 
 
202 aa  52  0.000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 
205 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 
204 aa  52  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  34.21 
 
 
208 aa  51.6  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  34.31 
 
 
208 aa  51.6  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  42.37 
 
 
197 aa  51.6  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  36.9 
 
 
198 aa  51.6  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  33.33 
 
 
211 aa  51.6  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  38.37 
 
 
209 aa  50.8  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 
205 aa  50.8  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 
205 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  36.62 
 
 
208 aa  50.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 
205 aa  50.8  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  43.1 
 
 
201 aa  50.4  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  40.62 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  38.98 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 
205 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  42.31 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  42.62 
 
 
208 aa  50.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  33.77 
 
 
206 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  41.82 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  34.38 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  33.33 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  32.47 
 
 
205 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  44.64 
 
 
208 aa  49.3  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  36.05 
 
 
200 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 
206 aa  49.3  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  41.38 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  44 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  51.11 
 
 
262 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  46.55 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 
208 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  43.1 
 
 
202 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  36.59 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  53.19 
 
 
205 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>