More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1801 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  67.22 
 
 		 181 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  64.13 
 
 		 185 aa  239  1e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  62.92 
 
 		 181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  59.66 
 
 		 181 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  50.55 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  50 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  48.62 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  50.56 
 
 		 187 aa  160  9e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  45.88 
 
 		 169 aa  147  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  45.71 
 
 		 177 aa  147  8e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  45.88 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  49.7 
 
 		 172 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  43.53 
 
 		 175 aa  142  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  45.76 
 
 		 178 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  43.02 
 
 		 173 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  45.2 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  44.63 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  44.63 
 
 		 178 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  44.24 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  45.68 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  40.72 
 
 		 180 aa  111  7.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  40.12 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  38.65 
 
 		 193 aa  99.4  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.61 
 
 		 194 aa  98.2  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  37.58 
 
 		 167 aa  97.1  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  39.76 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  40.99 
 
 		 159 aa  95.1  5e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  40.37 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  38.51 
 
 		 159 aa  92.8  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  38.51 
 
 		 159 aa  92.4  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  37.95 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  50.91 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  48.44 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  47.62 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  49.21 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  43.28 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  46.88 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.79 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  40.54 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  45.31 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  41.43 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  38.71 
 
 		 209 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  47.17 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  56.82 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  41.27 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  50 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  38.27 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  54.35 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  43.08 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  48 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  40.38 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  49.06 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  39.39 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  36.51 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000008  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  38.89 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf682  ribosomal protein S4  35.62 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000995603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  42.03 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  42.19 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  51.11 
 
 		 262 aa  53.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>