More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1100 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 177 aa  365  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  74.29 
 
 		 178 aa  285  2e-76  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  74.29 
 
 		 178 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  74.29 
 
 		 178 aa  284  4e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  72.57 
 
 		 178 aa  278  2e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  56.11 
 
 		 187 aa  193  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  51.83 
 
 		 169 aa  177  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  50.59 
 
 		 173 aa  174  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  51.15 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  48.5 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  49.43 
 
 		 183 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  48.19 
 
 		 173 aa  166  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  47.46 
 
 		 216 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  47.06 
 
 		 175 aa  163  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  47.7 
 
 		 181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 181 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  45.66 
 
 		 181 aa  160  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  48.15 
 
 		 172 aa  156  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  46.29 
 
 		 185 aa  157  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  45.4 
 
 		 181 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  45.71 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  43.21 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  48.45 
 
 		 180 aa  127  8.000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  41.25 
 
 		 201 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  39.51 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  40.12 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  40.38 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  39.74 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  38.71 
 
 		 167 aa  107  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  40.51 
 
 		 159 aa  107  8.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  37.65 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  38.61 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.97 
 
 		 194 aa  99.4  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  51.22 
 
 		 208 aa  74.3  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  38.1 
 
 		 206 aa  72  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  40.59 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  46.58 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  64.44 
 
 		 207 aa  67  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  55.93 
 
 		 205 aa  67  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 208 aa  67  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  57.69 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  41.89 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  52.73 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  38.05 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  36.69 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  42.71 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  37.62 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  41.05 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  55.77 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  42.57 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.59 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  37.62 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  36.27 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  37.72 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 205 aa  64.3  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  56.6 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  41.89 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  52.94 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  36.45 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  43.24 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  36.84 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  43.06 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  33.11 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  30.34 
 
 		 207 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3968  ribosomal protein S4  38 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  34.4 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 197 aa  62  0.000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  30.34 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  53.06 
 
 		 205 aa  62  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  34.86 
 
 		 208 aa  62  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  57.14 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  43.06 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  55.1 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  61.22 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  49.21 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  38.95 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  37.04 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  36.45 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  31.43 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  53.06 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  41.89 
 
 		 203 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  36.84 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  41.77 
 
 		 202 aa  60.8  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  36.04 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  55.1 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>