More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0478 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 197 aa  409  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  98.48 
 
 		 207 aa  401  1e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  97.46 
 
 		 207 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  52.02 
 
 		 208 aa  214  9e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  47.98 
 
 		 208 aa  206  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  49.49 
 
 		 208 aa  201  5e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  47.98 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  48.99 
 
 		 208 aa  199  3e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  47.47 
 
 		 209 aa  197  9e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  48.74 
 
 		 206 aa  194  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  46.97 
 
 		 208 aa  193  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  46.46 
 
 		 208 aa  191  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  48.74 
 
 		 208 aa  190  9e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  45.45 
 
 		 208 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 209 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  48.76 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  48.48 
 
 		 206 aa  184  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 208 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0252  RNA-binding S4 domain-containing protein  47.98 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  46.97 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 208 aa  182  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  46.46 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  48.73 
 
 		 208 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  47.24 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  43.94 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  47.76 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  47.74 
 
 		 208 aa  178  4e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 208 aa  177  8e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 211 aa  177  8e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 208 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.94 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  45.73 
 
 		 208 aa  176  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  47.26 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  46.97 
 
 		 208 aa  175  4e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 208 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  47.5 
 
 		 209 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  42.71 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  42.71 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 209 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1861  ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 208 aa  171  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  45.23 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  46 
 
 		 209 aa  171  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0449  30S ribosomal protein S4  45.23 
 
 		 208 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  43.22 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  47.74 
 
 		 208 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  45.36 
 
 		 200 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  42.71 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 209 aa  167  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  44.72 
 
 		 208 aa  167  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0523  ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645379  unclonable  0.0000000000198285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0353  ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 208 aa  167  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152733  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  44.72 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  42.71 
 
 		 207 aa  164  9e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  45.23 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  47.19 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  47.19 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  48.1 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  45.96 
 
 		 195 aa  159  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3292  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 207 aa  159  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  46.37 
 
 		 200 aa  158  5e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  40.91 
 
 		 208 aa  157  7e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  43.5 
 
 		 209 aa  157  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  40.91 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  45.51 
 
 		 200 aa  157  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 207 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  47.19 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  41.21 
 
 		 206 aa  156  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  40.7 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3272  30S ribosomal protein S4  41.21 
 
 		 207 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  40.7 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3619  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00390122  hitchhiker  0.00000000725029 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  43.56 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  41.21 
 
 		 207 aa  154  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  41.21 
 
 		 203 aa  154  8e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  44.72 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 206 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  39.2 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  41.21 
 
 		 206 aa  154  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  46.37 
 
 		 204 aa  153  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  45.18 
 
 		 197 aa  154  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0339  30S ribosomal protein S4  41.21 
 
 		 207 aa  153  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.411098  normal  0.0560525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>