More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2224 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  70.22 
 
 		 181 aa  261  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  66.85 
 
 		 181 aa  249  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  64.13 
 
 		 182 aa  239  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  60.8 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  50.82 
 
 		 183 aa  185  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  51.14 
 
 		 216 aa  177  8e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  51.43 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  49.15 
 
 		 187 aa  163  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  46.29 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  53.01 
 
 		 172 aa  154  1e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  44.38 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  44.97 
 
 		 175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  45.56 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  42.01 
 
 		 173 aa  149  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  45.71 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  46.86 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  45.71 
 
 		 178 aa  148  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  45.14 
 
 		 178 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  47.59 
 
 		 181 aa  137  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  48.54 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  46.01 
 
 		 193 aa  130  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  46.2 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  44.79 
 
 		 193 aa  124  5e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  42.94 
 
 		 201 aa  120  9e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  43.67 
 
 		 194 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  41.72 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  43.64 
 
 		 180 aa  117  7e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  45.4 
 
 		 159 aa  115  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  45.96 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  45.96 
 
 		 159 aa  112  3e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  43.75 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  55.56 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  45.59 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  50.85 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  46.03 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  58.62 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  36.47 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  40.54 
 
 		 207 aa  62  0.000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  39.19 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  39.51 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  46.75 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  47.92 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  52.24 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  39.58 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  47.76 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  41.89 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  50 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  56.9 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  51.92 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  43.55 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  43.75 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  32.43 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3968  ribosomal protein S4  50 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  39.08 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  52.08 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  50.85 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  37.84 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  41.89 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  48.48 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  49.28 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  39.13 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  51.92 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  40 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  41.89 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  39.76 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  46.55 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  37.63 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  46.43 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  48.28 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  55.17 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>