More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0565 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  96.63 
 
 		 178 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  96.63 
 
 		 178 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  93.26 
 
 		 178 aa  347  5e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  74.29 
 
 		 177 aa  285  2.9999999999999996e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 187 aa  187  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  53.7 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  49.72 
 
 		 184 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  48.86 
 
 		 183 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  48.81 
 
 		 173 aa  166  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  49.1 
 
 		 173 aa  165  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  48.48 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  46.43 
 
 		 175 aa  157  5e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  49.69 
 
 		 181 aa  157  9e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  43.96 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  44.25 
 
 		 181 aa  149  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  46.91 
 
 		 172 aa  149  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  45.14 
 
 		 185 aa  146  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  43.68 
 
 		 181 aa  143  1e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  44.63 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  42.2 
 
 		 181 aa  137  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  42.86 
 
 		 181 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  44.63 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  36.72 
 
 		 189 aa  109  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  41.14 
 
 		 159 aa  109  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  38.89 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  40.51 
 
 		 159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  41.14 
 
 		 159 aa  107  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  37.74 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  36.65 
 
 		 194 aa  105  3e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  40 
 
 		 159 aa  105  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  37.64 
 
 		 201 aa  104  7e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  36.97 
 
 		 167 aa  104  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  50.65 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  34.87 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  48.53 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  49.23 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 206 aa  67.8  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  56.14 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  55.93 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  37.86 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  48.57 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 224 aa  65.5  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  48.72 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  57.69 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  38.61 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  50.79 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  49.21 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  49.33 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  42.5 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  31.52 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  49.12 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  51.85 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  40.74 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  55.17 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  55.17 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 205 aa  60.8  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  50.85 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  30.43 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.7 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  51.72 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  41.79 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  49.18 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  49.15 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  46.03 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  55.17 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  49.06 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  51.72 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  49.18 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  49.18 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  50.85 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  54.72 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  53.7 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  45.61 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  46.75 
 
 		 262 aa  58.9  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  38.75 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  43.4 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  40.85 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>