More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2901 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  70.22 
 
 		 185 aa  261  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  67.22 
 
 		 182 aa  251  5.000000000000001e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  62.36 
 
 		 181 aa  229  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  57.95 
 
 		 181 aa  207  5e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  49.43 
 
 		 216 aa  178  4e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  48.55 
 
 		 183 aa  175  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  46.24 
 
 		 184 aa  169  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  51.41 
 
 		 187 aa  168  4e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  44.38 
 
 		 173 aa  160  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  44.97 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  45.4 
 
 		 177 aa  154  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  45.56 
 
 		 173 aa  152  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 173 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  50 
 
 		 172 aa  149  1e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  44.77 
 
 		 175 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  44.25 
 
 		 178 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  44.25 
 
 		 178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  43.68 
 
 		 178 aa  143  1e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  43.1 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  43.71 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  43.86 
 
 		 181 aa  124  8.000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  42.94 
 
 		 193 aa  124  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  42.59 
 
 		 193 aa  122  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  41.1 
 
 		 201 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  41.98 
 
 		 189 aa  117  7e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  39.88 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  39.49 
 
 		 167 aa  113  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.24 
 
 		 194 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  44.53 
 
 		 159 aa  103  1e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  43.75 
 
 		 159 aa  101  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  39.75 
 
 		 159 aa  100  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  39.84 
 
 		 159 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  56.86 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  43.21 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  40.24 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  50.91 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  50.91 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  56.25 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  50.91 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  49.09 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  49.06 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  59.09 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  51.72 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  46.43 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  54.17 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  50 
 
 		 209 aa  57.8  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  40.85 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  39.13 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  56.82 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  39.44 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  34.69 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  52.08 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  39.44 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  48 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  46.3 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  48.08 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  54.55 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  46.15 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  56.82 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  40.62 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  53.19 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  52.27 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  50 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  51.06 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  35.06 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  47.27 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  35.06 
 
 		 209 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  42.62 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  54.35 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  52.27 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  52.27 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  48.89 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  35.29 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>