More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2523 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 169 aa  343  6e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  74.71 
 
 		 173 aa  259  1e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  70.76 
 
 		 173 aa  240  7.999999999999999e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  68.6 
 
 		 175 aa  238  2e-62  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  67.25 
 
 		 173 aa  235  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  53.7 
 
 		 178 aa  180  6e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  54.32 
 
 		 178 aa  180  7e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  53.7 
 
 		 178 aa  178  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  51.83 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  52.47 
 
 		 178 aa  173  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  50 
 
 		 183 aa  170  7.999999999999999e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  46.15 
 
 		 184 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  45.93 
 
 		 216 aa  165  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  50 
 
 		 187 aa  161  3e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  46.15 
 
 		 181 aa  156  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  44.97 
 
 		 181 aa  154  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  45.83 
 
 		 181 aa  153  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  44.38 
 
 		 185 aa  151  4e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  45.88 
 
 		 182 aa  147  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  50.64 
 
 		 172 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  47.62 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  41.03 
 
 		 193 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  42.76 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  39.74 
 
 		 194 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  37.65 
 
 		 201 aa  110  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  40 
 
 		 167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  40.13 
 
 		 189 aa  106  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  38.22 
 
 		 193 aa  105  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  46.88 
 
 		 159 aa  103  2e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  44.62 
 
 		 159 aa  102  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  44.53 
 
 		 159 aa  101  6e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  43.85 
 
 		 159 aa  100  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  37.66 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  37.9 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  41.9 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  35.88 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  38.52 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  56.6 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  50.77 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  40.85 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  54.72 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  63.64 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  31.06 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  51.92 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  36.84 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  41.38 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 207 aa  62  0.000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  46.77 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  36.51 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  33.78 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  39.22 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  45.31 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  38.46 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  34.85 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  42.19 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  36.73 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  35.66 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  35.96 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  35.46 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  35.66 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  49.15 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  42.19 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  37.97 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  52 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  44.59 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  57.78 
 
 		 262 aa  59.3  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  42.42 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  39.08 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  50 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  32.54 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  41.54 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf682  ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000995603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  38.46 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  48.21 
 
 		 200 aa  57.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  45.31 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  48.39 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  47.76 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  47.76 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  44.59 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  44.59 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  40.62 
 
 		 198 aa  57.8  0.00000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  45.31 
 
 		 204 aa  57.4  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  44.59 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  56.52 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  44.78 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  41.27 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  41.1 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>