293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2553 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  100 
 
 		 173 aa  347  4e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  89.6 
 
 		 173 aa  320  5e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  67.25 
 
 		 169 aa  235  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  67.63 
 
 		 173 aa  234  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  63.22 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  48.5 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  48.81 
 
 		 178 aa  169  2e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  49.13 
 
 		 187 aa  167  6e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  48.81 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  48.81 
 
 		 178 aa  166  1e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  49.4 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  50 
 
 		 178 aa  160  6e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  49.7 
 
 		 183 aa  160  1e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  47.67 
 
 		 216 aa  156  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  45.56 
 
 		 184 aa  153  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  43.2 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  43.2 
 
 		 185 aa  150  8e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  46.47 
 
 		 181 aa  148  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  45.86 
 
 		 172 aa  141  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  43.02 
 
 		 182 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  47.97 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  42.04 
 
 		 193 aa  123  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  41.94 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.03 
 
 		 194 aa  114  5e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  40.76 
 
 		 189 aa  114  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  40.65 
 
 		 167 aa  107  8.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  35.58 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  39.19 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  39.74 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  39.23 
 
 		 159 aa  93.6  1e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  39.2 
 
 		 159 aa  90.9  9e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  37.01 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  40.8 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  30.28 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  44.78 
 
 		 203 aa  62  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  49.15 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  28.97 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  28.48 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  35.11 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  30.72 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  54 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  33.62 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  35.44 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  30.38 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  52 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  32.76 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  45 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  39.44 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  40.26 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  49.15 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  43.04 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  42.62 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  59.09 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  43.4 
 
 		 207 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  39.34 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  39.44 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.36 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  38.03 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  37.7 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  36.62 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  37.7 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  41.51 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  38.33 
 
 		 203 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  46.03 
 
 		 201 aa  52.4  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  35.9 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  38.33 
 
 		 203 aa  52.4  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  44.07 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  35.29 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  34.21 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 209 aa  52  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  38.33 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  43.64 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  38.98 
 
 		 197 aa  51.6  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  37.21 
 
 		 200 aa  51.6  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  42.37 
 
 		 206 aa  51.2  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  42.37 
 
 		 206 aa  51.6  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  38.18 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>