129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_6847 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  100 
 
 		 167 aa  340  8e-93  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  73.05 
 
 		 194 aa  246  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  68.86 
 
 		 193 aa  237  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  68.29 
 
 		 193 aa  231  3e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  64.07 
 
 		 189 aa  222  2e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  41.92 
 
 		 183 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  46.2 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  44.3 
 
 		 181 aa  120  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  44.1 
 
 		 172 aa  117  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  43.03 
 
 		 181 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  39.49 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  40 
 
 		 169 aa  110  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  41.88 
 
 		 181 aa  108  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  37.27 
 
 		 216 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  38.71 
 
 		 177 aa  107  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  40.65 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  40.38 
 
 		 175 aa  105  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  38.71 
 
 		 173 aa  104  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  36.97 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  38.71 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  35.76 
 
 		 178 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  38.06 
 
 		 173 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  35.76 
 
 		 178 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  36.36 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  36.48 
 
 		 184 aa  98.2  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  40.67 
 
 		 181 aa  97.8  6e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  37.58 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  38.16 
 
 		 201 aa  94  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  40.3 
 
 		 159 aa  89  3e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  39.58 
 
 		 159 aa  86.3  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  40.3 
 
 		 159 aa  84.7  5e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  38.81 
 
 		 159 aa  84  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  38.71 
 
 		 180 aa  82.8  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  46 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  38.71 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  38.71 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  24.03 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 206 aa  47.8  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  27.89 
 
 		 208 aa  47.4  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  26.95 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  25.74 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  49.09 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  37.14 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  42.62 
 
 		 203 aa  45.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  27.45 
 
 		 208 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 197 aa  45.1  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 224 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 208 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  34.12 
 
 		 208 aa  45.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 208 aa  44.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  44.7  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1641  ribosomal protein S4  44.68 
 
 		 201 aa  44.7  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  44.9 
 
 		 209 aa  44.7  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  26.8 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  26.8 
 
 		 208 aa  44.7  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 201 aa  44.3  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1004  30S ribosomal protein S4  34.38 
 
 		 204 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000950762  normal  0.0219645 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  38.1 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  43.4 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  39.22 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  43.64 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  40.43 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  28.36 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1391  RNA-binding S4 domain-containing protein  44.68 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  36.21 
 
 		 202 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0388  30S ribosomal protein S4  31.08 
 
 		 204 aa  42.7  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0418  30S ribosomal protein S4  48.89 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0394  30S ribosomal protein S4  48.89 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  40.74 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0583  ribosomal protein S4  34.43 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  42.55 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  33.33 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  37.1 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  38.71 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1830  30S ribosomal protein S4  44.68 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00631907  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0361  30S ribosomal protein S4  44.68 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000770574  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  36.49 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 205 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 205 aa  42.4  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2301  ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 208 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0792347  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  39.22 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  38.3 
 
 		 201 aa  42.4  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 202 aa  42.4  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 206 aa  42.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  37.1 
 
 		 208 aa  42.4  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  36.73 
 
 		 206 aa  42  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  36.73 
 
 		 206 aa  42  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  35.8 
 
 		 208 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  37.1 
 
 		 208 aa  42  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>