168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0324 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  46.99 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 187 aa  130  9e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  49.03 
 
 		 181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  44.17 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  42.94 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  41.1 
 
 		 181 aa  118  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  41.25 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  41.88 
 
 		 181 aa  115  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  48.75 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  37.95 
 
 		 181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  37.65 
 
 		 169 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  37.58 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  35.58 
 
 		 173 aa  107  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  37.89 
 
 		 183 aa  107  2e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  39.88 
 
 		 178 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  37.64 
 
 		 178 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  35.58 
 
 		 173 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  37.64 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  40.12 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  37.08 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  35.71 
 
 		 216 aa  101  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  38.41 
 
 		 193 aa  97.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  37.89 
 
 		 184 aa  97.4  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  34.15 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  38.16 
 
 		 167 aa  94  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  40 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  39.35 
 
 		 159 aa  93.2  2e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  37.72 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  40 
 
 		 159 aa  92  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.74 
 
 		 194 aa  91.7  7e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  37.42 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  36.59 
 
 		 193 aa  88.6  5e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  37.5 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  35.51 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  48.39 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  54.1 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  54.1 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  36.36 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  29.58 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  35.51 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  29.58 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  29.58 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  29.58 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  50.82 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  34.26 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  28.77 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  28.77 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  50.82 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  24.74 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  36.08 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  49.06 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  45 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  40.74 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  28.17 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  42.7 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0478  30S ribosomal protein S4  46.3 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000852694  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  38.37 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  26.14 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  32.41 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  27.82 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  34.69 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  28.17 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  34.48 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  33.03 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  28.57 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  35.63 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 209 aa  48.5  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  25.73 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  31.96 
 
 		 208 aa  48.1  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  26.71 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  40.74 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  35.24 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl586  30S ribosomal protein S4  54.35 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000352215  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  35.96 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  32.41 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  39.33 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  26.71 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  27.27 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  36.36 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  30.08 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  36.51 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  30.56 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  32.41 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  38.55 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  26.71 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2261  ribosomal protein S4  38.04 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352752  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  36.25 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  25.9 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  27.46 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  32.22 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  26.03 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  48.98 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>