More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1110 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  413  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  60.89 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  58.42 
 
 		 202 aa  237  6.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  60.7 
 
 		 208 aa  237  8e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  57.07 
 
 		 205 aa  236  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  59.22 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  59.71 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  57.07 
 
 		 208 aa  234  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  56.65 
 
 		 203 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  58.05 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  55.61 
 
 		 208 aa  232  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  56.59 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  57.35 
 
 		 208 aa  229  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  57.92 
 
 		 202 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.05 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  56.44 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  55.61 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  52.22 
 
 		 203 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  53.92 
 
 		 204 aa  207  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  50.76 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  50.76 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  51.78 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  51.78 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  51.78 
 
 		 201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  47.5 
 
 		 206 aa  178  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  51.27 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  51.27 
 
 		 201 aa  177  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  46.46 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  51.78 
 
 		 201 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 201 aa  175  4e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  48 
 
 		 205 aa  174  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  46 
 
 		 206 aa  173  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 200 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46 
 
 		 206 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  48.22 
 
 		 201 aa  172  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  49.46 
 
 		 208 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  46.7 
 
 		 202 aa  170  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  48.19 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  48.19 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  50.57 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  50.57 
 
 		 208 aa  168  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  45.32 
 
 		 208 aa  167  7e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  47.21 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 208 aa  166  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  44.1 
 
 		 203 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  47.28 
 
 		 209 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  50 
 
 		 209 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 208 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  43.08 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 203 aa  163  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  46.7 
 
 		 201 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  42.56 
 
 		 203 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  44.33 
 
 		 208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  46.2 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  43.88 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  45.51 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 203 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 208 aa  160  9e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  42.56 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  44.04 
 
 		 200 aa  159  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 208 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  44 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 209 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  47.28 
 
 		 208 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  42.36 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 205 aa  156  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  43.75 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  41.75 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  43.96 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  41.87 
 
 		 208 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  41.12 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  42.71 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 208 aa  154  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  41.38 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  45.76 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 205 aa  152  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  46.07 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  45 
 
 		 262 aa  153  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  43.35 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  42.29 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>