More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4818 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 202 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  92.57 
 
 		 202 aa  363  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  69.46 
 
 		 200 aa  278  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  64.53 
 
 		 203 aa  247  7e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  58.42 
 
 		 202 aa  237  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  59.09 
 
 		 201 aa  228  4e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  60.49 
 
 		 208 aa  225  3e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  57.56 
 
 		 208 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  57.07 
 
 		 208 aa  219  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  59.2 
 
 		 208 aa  218  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  62.24 
 
 		 208 aa  218  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  57.56 
 
 		 205 aa  216  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  59.2 
 
 		 208 aa  216  2.9999999999999998e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  55.34 
 
 		 208 aa  210  1e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  53.92 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  54.15 
 
 		 208 aa  207  9e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  54.73 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  54.36 
 
 		 208 aa  205  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 203 aa  203  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  47.29 
 
 		 203 aa  191  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  45 
 
 		 206 aa  154  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 200 aa  152  4e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  44.5 
 
 		 206 aa  151  5e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  43.37 
 
 		 203 aa  151  8e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  44.9 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  45.16 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  44.39 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  41.92 
 
 		 201 aa  147  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  41.41 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  43.37 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 201 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  40.1 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 203 aa  143  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  42.05 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  41.84 
 
 		 203 aa  141  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 201 aa  141  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  43 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  41.33 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  39.5 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  45.41 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  43.22 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  41.5 
 
 		 202 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  44.94 
 
 		 201 aa  139  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  41.85 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.86 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  42.39 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0437  ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 203 aa  137  1e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000069036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4418  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000122066  normal  0.206155 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4356  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  43.82 
 
 		 201 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  44.02 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  41.38 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  40.54 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.55 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  39.11 
 
 		 197 aa  135  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  40.39 
 
 		 208 aa  135  5e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  45.3 
 
 		 205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  39.11 
 
 		 197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  40.22 
 
 		 208 aa  134  7.000000000000001e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  42.94 
 
 		 208 aa  134  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  41.87 
 
 		 197 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  41.79 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 205 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  39.9 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  42.7 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  41.94 
 
 		 208 aa  134  9.999999999999999e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  40.39 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  41.57 
 
 		 208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 205 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>