More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4934 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 203 aa  408  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  64.53 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  65.02 
 
 		 200 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  65.52 
 
 		 202 aa  255  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  62.07 
 
 		 208 aa  243  9.999999999999999e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  62.44 
 
 		 205 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  57.64 
 
 		 202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  62.25 
 
 		 208 aa  241  7e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  60.78 
 
 		 208 aa  241  7.999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  60.78 
 
 		 208 aa  239  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  58.05 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  59.02 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  58.05 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  58.05 
 
 		 208 aa  233  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  54.15 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  53.66 
 
 		 208 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.22 
 
 		 201 aa  213  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 204 aa  184  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  48.74 
 
 		 203 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  47.74 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  48.48 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  49.49 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  46.97 
 
 		 202 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  42.42 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  45.96 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  45.96 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20600  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 202 aa  160  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.725693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  48.11 
 
 		 208 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  46.46 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 201 aa  158  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  43.5 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 203 aa  156  2e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  45.96 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  46.2 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  45 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  43.15 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  45.51 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  42.5 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  46.63 
 
 		 201 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  45.77 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  46.27 
 
 		 206 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  41.5 
 
 		 203 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  41.5 
 
 		 203 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  44.38 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  41.79 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  45.41 
 
 		 209 aa  148  5e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  44.38 
 
 		 208 aa  147  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  43.22 
 
 		 200 aa  147  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6023  30S ribosomal protein S4  44.32 
 
 		 209 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0609  30S ribosomal protein S4  43.78 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.19344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  43.24 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 206 aa  142  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  44.86 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  42.02 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  42.7 
 
 		 208 aa  140  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  41.85 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  43.32 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  43.68 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  42.78 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  40.64 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  44.92 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 200 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  43.32 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 204 aa  139  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  41.08 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  40.49 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  37.32 
 
 		 208 aa  138  4.999999999999999e-32  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  40 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  40.49 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  40.49 
 
 		 205 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 200 aa  138  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  38.83 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  43.09 
 
 		 209 aa  137  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  41.71 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 205 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  39.46 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  45.41 
 
 		 208 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  42.02 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  38.92 
 
 		 206 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>