More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1686 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  91.83 
 
 		 208 aa  388  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  83.65 
 
 		 208 aa  354  3.9999999999999996e-97  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  84.88 
 
 		 205 aa  353  1e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  76.44 
 
 		 208 aa  327  7e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  74.04 
 
 		 208 aa  319  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  74.52 
 
 		 208 aa  315  3e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  73.08 
 
 		 208 aa  311  2.9999999999999996e-84  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  72.12 
 
 		 208 aa  307  6.999999999999999e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  72.12 
 
 		 208 aa  304  6e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  70.67 
 
 		 208 aa  298  5e-80  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  62.69 
 
 		 200 aa  247  7e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  56.59 
 
 		 202 aa  231  7.000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  59.02 
 
 		 203 aa  229  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  57.07 
 
 		 202 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  56.78 
 
 		 203 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.3 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  55.28 
 
 		 203 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  56.1 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  48.5 
 
 		 204 aa  178  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  48.22 
 
 		 200 aa  176  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  46.7 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  43.15 
 
 		 203 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 200 aa  160  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  44.67 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  42.56 
 
 		 200 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  44.67 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  41.76 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  41.09 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  40.61 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  39.5 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  38.58 
 
 		 203 aa  149  2e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  41.09 
 
 		 206 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  42.64 
 
 		 202 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  38.58 
 
 		 203 aa  148  6e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  45.86 
 
 		 201 aa  148  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  41.26 
 
 		 206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  41.84 
 
 		 203 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  43.28 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  43.08 
 
 		 202 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  40.29 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  37.62 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  42.42 
 
 		 201 aa  145  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  40.8 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  39.13 
 
 		 201 aa  145  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  39.11 
 
 		 203 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  42.13 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  43.33 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  39.44 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  42.21 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  42.78 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  39.09 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  42 
 
 		 205 aa  141  6e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 208 aa  141  7e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  39.81 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  40.29 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  40.29 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  43.89 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  41.29 
 
 		 206 aa  140  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  40.78 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  43.89 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 208 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  42.77 
 
 		 197 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  37.86 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  39.11 
 
 		 206 aa  138  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  39.41 
 
 		 208 aa  138  6e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  40.7 
 
 		 204 aa  138  7e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  39.9 
 
 		 208 aa  138  7e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1590  30S ribosomal protein S4  40.3 
 
 		 202 aa  137  7.999999999999999e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  39.9 
 
 		 208 aa  137  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  42.77 
 
 		 198 aa  137  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  39.6 
 
 		 206 aa  137  8.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  39.39 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  39.71 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0787  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  40.56 
 
 		 208 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  39.42 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1134  ribosomal protein S4  42.59 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00609491  normal  0.0863667 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  41.11 
 
 		 208 aa  136  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  38.35 
 
 		 206 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  36 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  40.29 
 
 		 205 aa  136  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>