More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0623 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  421  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  92.31 
 
 		 208 aa  394  1e-109  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  74.52 
 
 		 208 aa  315  3e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  73.08 
 
 		 208 aa  306  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  71.15 
 
 		 208 aa  303  1.0000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  71.43 
 
 		 205 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  67.79 
 
 		 208 aa  288  4e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  66.83 
 
 		 208 aa  287  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  65.87 
 
 		 208 aa  278  5e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  64.9 
 
 		 208 aa  272  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  62.5 
 
 		 208 aa  264  8.999999999999999e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  60.2 
 
 		 200 aa  236  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  56.44 
 
 		 202 aa  214  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.33 
 
 		 201 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  53.66 
 
 		 203 aa  207  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  54.73 
 
 		 202 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  55.28 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  53.77 
 
 		 203 aa  201  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  52.74 
 
 		 202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  184  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  50.5 
 
 		 204 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  178  5.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  47.72 
 
 		 200 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  47.21 
 
 		 200 aa  175  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  47.21 
 
 		 200 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 203 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  46.7 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  43.15 
 
 		 203 aa  167  1e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  45.64 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  45.27 
 
 		 205 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  42.64 
 
 		 203 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  46.04 
 
 		 206 aa  159  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  45 
 
 		 206 aa  159  3e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  39.59 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  42.35 
 
 		 203 aa  158  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  40.61 
 
 		 203 aa  158  5e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  44.5 
 
 		 205 aa  158  6e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  41.12 
 
 		 203 aa  157  8e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  40.61 
 
 		 203 aa  157  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  42.78 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  48.72 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  47.21 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  42.64 
 
 		 200 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 208 aa  154  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 202 aa  154  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  40.49 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  44.95 
 
 		 206 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  43.78 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  39.22 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  44 
 
 		 206 aa  151  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  39.67 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  40.39 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  45.18 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  41.87 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  45.18 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  42.36 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  43.43 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  41.87 
 
 		 208 aa  149  4e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0202  ribosomal protein S4  43.15 
 
 		 203 aa  148  5e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  41.87 
 
 		 208 aa  147  7e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  41.55 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  43.89 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  43.08 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  45.18 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  37.68 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  43.37 
 
 		 203 aa  146  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  45.21 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  46.28 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0264  30S ribosomal protein S4  42.71 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  40 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  42.54 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  40.91 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  37.38 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  38.73 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  38.73 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  38.73 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  38.54 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  39.9 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4287  30S ribosomal protein S4  42.54 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000360056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  44.44 
 
 		 201 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 208 aa  142  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  40.39 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  44.67 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  44.67 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  44.67 
 
 		 201 aa  142  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1487  30S ribosomal protein S4  43.84 
 
 		 202 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>