More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2281 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  416  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  96.63 
 
 		 208 aa  403  1e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  79.81 
 
 		 208 aa  338  2e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2011  30S ribosomal protein S4  74.04 
 
 		 208 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0658293  normal  0.432018 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1686  ribosomal protein S4  72.12 
 
 		 208 aa  304  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.367201  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17660  SSU ribosomal protein S4P  74.51 
 
 		 205 aa  301  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.029171  normal  0.0852313 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  71.15 
 
 		 208 aa  300  7.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1354  30S ribosomal protein S4  68.27 
 
 		 208 aa  290  9e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16370  30S ribosomal protein S4  67.31 
 
 		 208 aa  289  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0623  30S ribosomal protein S4  64.9 
 
 		 208 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.115824  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0369  ribosomal protein S4  64.42 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  64.18 
 
 		 200 aa  239  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  59.22 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4934  30S ribosomal protein S4  62.25 
 
 		 203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4818  30S ribosomal protein S4  62.24 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  58.13 
 
 		 201 aa  214  9e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4369  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 202 aa  201  5e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  51.27 
 
 		 203 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3152  ribosomal protein S4  50.25 
 
 		 203 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  49.49 
 
 		 204 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  46.23 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  42.36 
 
 		 203 aa  166  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  42.42 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 203 aa  165  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  46.7 
 
 		 200 aa  165  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 200 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  45.13 
 
 		 200 aa  162  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  45.64 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  40.91 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  46.19 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  45.64 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  40.89 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  41.41 
 
 		 203 aa  162  3e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 203 aa  161  6e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 200 aa  161  6e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  44.28 
 
 		 205 aa  160  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  45.69 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 208 aa  155  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  44.22 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  42.44 
 
 		 206 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  43.17 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  45 
 
 		 206 aa  155  6e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  43.5 
 
 		 206 aa  154  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2129  SSU ribosomal protein S4P  40.91 
 
 		 200 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  44.23 
 
 		 206 aa  153  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  44.72 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  46.52 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  46.67 
 
 		 208 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  45.96 
 
 		 202 aa  151  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  43.28 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  44.62 
 
 		 202 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  42.72 
 
 		 205 aa  151  7e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 205 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3670  ribosomal protein S4  45.3 
 
 		 201 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  41 
 
 		 205 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  43.2 
 
 		 208 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  44.13 
 
 		 209 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  43.69 
 
 		 204 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 206 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  42.86 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  42.71 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  45 
 
 		 205 aa  148  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  43.72 
 
 		 201 aa  148  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  38.38 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  45.5 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  44.5 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  40.98 
 
 		 205 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 206 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 205 aa  145  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  42.79 
 
 		 205 aa  146  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  42.36 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  44.5 
 
 		 205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  44.5 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  41.87 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  41.87 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  41.87 
 
 		 208 aa  144  6e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  43 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  43.5 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  43.5 
 
 		 205 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  42.36 
 
 		 208 aa  144  8.000000000000001e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  42 
 
 		 206 aa  144  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>