More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0258 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 172 aa  347  6e-95  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  60.67 
 
 		 181 aa  201  6e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  52.27 
 
 		 181 aa  175  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  52.69 
 
 		 187 aa  168  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  58.49 
 
 		 159 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  59.62 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  55.9 
 
 		 180 aa  160  9e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  51.81 
 
 		 183 aa  158  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  57.05 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  48.15 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  48.77 
 
 		 178 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  55.13 
 
 		 159 aa  154  6e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  53.01 
 
 		 185 aa  154  9e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  48.21 
 
 		 184 aa  152  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  47.06 
 
 		 216 aa  151  5e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  49.7 
 
 		 181 aa  150  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  47.53 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  50 
 
 		 181 aa  149  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  47.53 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  46.91 
 
 		 178 aa  149  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  50.64 
 
 		 169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  48.02 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  49.7 
 
 		 182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  49.68 
 
 		 173 aa  144  9e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  45.86 
 
 		 173 aa  141  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  46.99 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  47.44 
 
 		 173 aa  138  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  43.48 
 
 		 175 aa  132  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  41.42 
 
 		 193 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  44.1 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  41.51 
 
 		 193 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.67 
 
 		 194 aa  112  3e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  40.74 
 
 		 189 aa  111  5e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  30.2 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37810  predicted protein  27.03 
 
 		 183 aa  67.4  0.00000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000622727 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06171  U3 small nucleolar ribonucleoprotein subunit (Imp3), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08320)  29.66 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.102135  normal  0.241972 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  40.38 
 
 		 206 aa  64.7  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00090  u3 small nucleolar ribonucleoprotein protein imp3, putative  27.78 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  40.91 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  55.17 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  50.79 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  60 
 
 		 208 aa  60.8  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  60.87 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  62.22 
 
 		 208 aa  60.5  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15757  predicted protein  25.49 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319753  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1171  30S ribosomal protein S4  50.82 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  47.62 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  62.22 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  46.03 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  46.03 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  52.83 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  54.9 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4000  ribosomal protein S4  60 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00226649  hitchhiker  0.000661916 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3383  ribosomal protein S4  59.57 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 208 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  57.78 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  46.97 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  53.19 
 
 		 207 aa  57.8  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  56 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  50.94 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6584  30S ribosomal protein S4  55.32 
 
 		 201 aa  57  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.234143  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0237  30S ribosomal protein S4  34.88 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0862147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 202 aa  57  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  57.78 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  39.76 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  53.06 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1548  ribosomal protein S4  54.35 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2668  30S ribosomal protein S4  37.14 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.544911  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2354  30S ribosomal protein S4  37.14 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  50.88 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  58.14 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  52.17 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  35.35 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  59.09 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3968  ribosomal protein S4  50 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  34.48 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  44.9 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4971  30S ribosomal protein S4  55.32 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.557252 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  46.94 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  54.35 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  44.59 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1435  30S ribosomal protein S4  55.32 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01440  SSU ribosomal protein S4P  57.78 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.164406  normal  0.69794 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  51.02 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  55.32 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  55.32 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  55.32 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  44.83 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  60 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.17 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  55.81 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3403  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 204 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0173311  normal  0.29529 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 206 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1391  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.57 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13495  30S ribosomal protein S4  53.19 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000412742  normal  0.375665 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>