273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2590 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2590  30S ribosomal protein S4P  100 
 
 		 173 aa  352  1e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325159  normal  0.37704 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2523  30S ribosomal protein S4P  74.71 
 
 		 169 aa  259  1e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0154222  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1817  30S ribosomal protein S4P  65.14 
 
 		 175 aa  240  7.999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0421  ribosomal protein S4  68.79 
 
 		 173 aa  239  1e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2553  ribosomal protein S4  67.63 
 
 		 173 aa  234  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1100  30S ribosomal protein S4P  48.19 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1397  ribosomal protein S4  50.29 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.861603  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0273  30S ribosomal protein S4P  49.09 
 
 		 178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1353  30S ribosomal protein S4P  49.7 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.49235  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0037  30S ribosomal protein S4P  49.7 
 
 		 184 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0631  30S ribosomal protein S4P  48.48 
 
 		 178 aa  160  7e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0565  30S ribosomal protein S4P  48.48 
 
 		 178 aa  160  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1619  30S ribosomal protein S4P  49.11 
 
 		 183 aa  156  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0077  30S ribosomal protein S4P  45.35 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2901  30S ribosomal protein S4P  45.56 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.104435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2224  30S ribosomal protein S4P  45.56 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1801  30S ribosomal protein S4P  45.88 
 
 		 182 aa  147  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147092  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2387  30S ribosomal protein S4P  44.05 
 
 		 181 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.331094  normal  0.66938 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0258  30S ribosomal protein S4P  49.68 
 
 		 172 aa  144  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1246  30S ribosomal protein S4P  43.79 
 
 		 181 aa  136  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.0000703727  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1054  ribosomal protein S4  48.3 
 
 		 181 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00520973  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04803  hypothetical protein similar to 40S ribosomal protein S9 (Broad)  41.67 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1103  30S ribosomal protein S4P  46.36 
 
 		 181 aa  115  3e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.798829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77059  predicted protein  41.94 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425894  normal  0.528605 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02160  hypothetical protein  40.13 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0324  30S ribosomal protein S4P  37.58 
 
 		 201 aa  108  3e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94716  Ribosomal protein S9, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  38.46 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.321448 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6847  predicted protein  38.71 
 
 		 167 aa  104  6e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0909  30S ribosomal protein S4P  43.41 
 
 		 159 aa  104  7e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2147  30S ribosomal protein S4P  39.22 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000057291  hitchhiker  0.000326283 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1422  30S ribosomal protein S4P  42.64 
 
 		 159 aa  99.8  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.186865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0971  30S ribosomal protein S4P  40.31 
 
 		 159 aa  99  3e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.160491 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1893  30S ribosomal protein S4P  44 
 
 		 159 aa  97.1  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  47.46 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  36.56 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  45.9 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  46.43 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  43.28 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  44.64 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  44.64 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  39.06 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  39.44 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  50.98 
 
 		 205 aa  54.3  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5891  RNA-binding S4 domain protein  37.5 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  36.56 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  46.43 
 
 		 208 aa  53.9  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1226  30S ribosomal protein S4  45.45 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  48.15 
 
 		 205 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  43.86 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  36.36 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  44.64 
 
 		 208 aa  52.8  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  36.36 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0566  30S ribosomal protein S4  27.69 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  35.16 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  37.88 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0632  30S ribosomal protein S4  40.35 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000140472  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  47.06 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  30.37 
 
 		 208 aa  52  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29359  predicted protein  31.76 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.14949  normal  0.731108 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0292  30S ribosomal protein S4  48 
 
 		 207 aa  51.2  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188387  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6298  RNA-binding S4 domain-containing protein  53.33 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.661836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  51.11 
 
 		 204 aa  51.2  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19720  SSU ribosomal protein S4P  37.5 
 
 		 198 aa  50.8  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000575799  normal  0.771365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  35.94 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2998  ribosomal protein S4  46 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00785982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  43.86 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  46.15 
 
 		 209 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  41.38 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0340  ribosomal protein S4  56.76 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  50 
 
 		 262 aa  49.7  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  51.11 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  44 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  46 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  48.98 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  37.04 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  35.48 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1110  ribosomal protein S4  43.1 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.087009  normal  0.350174 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  43.86 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  37.14 
 
 		 208 aa  48.9  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  39.29 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  48.98 
 
 		 205 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  48.98 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  37.7 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1159  ribosomal protein S4  48.94 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286157  normal  0.0899698 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  48.94 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  40.82 
 
 		 208 aa  48.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  48.94 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3896  30S ribosomal protein S4  42.86 
 
 		 208 aa  48.5  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  42.11 
 
 		 206 aa  48.1  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>