More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5891 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5891  RNA-binding S4 domain protein  100 
 
 		 146 aa  299  8.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  81.02 
 
 		 205 aa  235  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  81.02 
 
 		 205 aa  233  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  79.56 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  80.29 
 
 		 205 aa  230  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1514  30S ribosomal protein S4  79.56 
 
 		 205 aa  225  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  72.03 
 
 		 206 aa  222  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  76.64 
 
 		 205 aa  221  3e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  74.13 
 
 		 206 aa  221  4e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  76.64 
 
 		 205 aa  220  6e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  75.18 
 
 		 205 aa  219  9.999999999999999e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  74.45 
 
 		 205 aa  216  8.999999999999998e-56  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  72.03 
 
 		 206 aa  216  8.999999999999998e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  69.23 
 
 		 206 aa  214  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  70.63 
 
 		 206 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  70.63 
 
 		 206 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  69.23 
 
 		 206 aa  213  5.9999999999999996e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  71.53 
 
 		 205 aa  209  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  72.26 
 
 		 205 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  71.53 
 
 		 205 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  70.8 
 
 		 206 aa  207  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  70.8 
 
 		 205 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  72.26 
 
 		 205 aa  204  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  70.8 
 
 		 204 aa  201  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  65.73 
 
 		 205 aa  201  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  70.07 
 
 		 205 aa  201  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  65.73 
 
 		 205 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  68.61 
 
 		 205 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  65.73 
 
 		 205 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  67.14 
 
 		 205 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  65.03 
 
 		 205 aa  197  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  66.42 
 
 		 205 aa  197  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  66.43 
 
 		 205 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  62.68 
 
 		 205 aa  189  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  62.77 
 
 		 205 aa  188  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  63.38 
 
 		 205 aa  187  2.9999999999999997e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  63.5 
 
 		 205 aa  186  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  62.77 
 
 		 205 aa  183  6e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1140  30S ribosomal protein S4  59.44 
 
 		 204 aa  177  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.768431  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2245  30S ribosomal protein S4  55.94 
 
 		 203 aa  175  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892305  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0701  30S ribosomal protein S4  58.09 
 
 		 204 aa  174  3e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0786  30S ribosomal protein S4  55.24 
 
 		 203 aa  163  5.9999999999999996e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  0.376942 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0194  30S ribosomal protein S4  46.72 
 
 		 202 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0912  30S ribosomal protein S4  47.45 
 
 		 202 aa  137  6e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0388  30S ribosomal protein S4  44.53 
 
 		 204 aa  131  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  47.45 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  47.83 
 
 		 207 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0274  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0146675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0339  30S ribosomal protein S4  47.1 
 
 		 207 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.411098  normal  0.0560525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3619  30S ribosomal protein S4  47.1 
 
 		 207 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00390122  hitchhiker  0.00000000725029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  49.29 
 
 		 200 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  47.1 
 
 		 207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  48.18 
 
 		 200 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  47.1 
 
 		 207 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 207 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  124  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  124  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 213 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  47.1 
 
 		 207 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 206 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 207 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0583  ribosomal protein S4  41.91 
 
 		 205 aa  123  7e-28  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 207 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 207 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  48.57 
 
 		 200 aa  123  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  44.2 
 
 		 207 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 206 aa  122  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3272  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  47.86 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 207 aa  120  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 207 aa  120  5e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  47.86 
 
 		 200 aa  120  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001718  SSU ribosomal protein S4p (S9e)  43.48 
 
 		 206 aa  120  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000581298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  44.2 
 
 		 207 aa  120  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00753  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  120  6e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  46.38 
 
 		 207 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3727  30S ribosomal protein S4  44.2 
 
 		 206 aa  119  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00253397  hitchhiker  0.00505868 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  43.36 
 
 		 211 aa  119  9.999999999999999e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  45.65 
 
 		 207 aa  119  9.999999999999999e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 207 aa  118  1.9999999999999998e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  43.8 
 
 		 200 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3292  30S ribosomal protein S4  42.75 
 
 		 207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  41.3 
 
 		 206 aa  118  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  44.93 
 
 		 206 aa  118  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  43.48 
 
 		 206 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>