More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD0388 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002978  WD0388  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0912  30S ribosomal protein S4  71.64 
 
 		 202 aa  308  4e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0194  30S ribosomal protein S4  70.5 
 
 		 202 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0583  ribosomal protein S4  54.68 
 
 		 205 aa  228  6e-59  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  51.71 
 
 		 205 aa  223  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  52.2 
 
 		 205 aa  218  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  51.71 
 
 		 205 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 205 aa  216  1e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  51.71 
 
 		 205 aa  216  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 205 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 205 aa  211  4.9999999999999996e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  49.02 
 
 		 205 aa  210  1e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1514  30S ribosomal protein S4  49.27 
 
 		 205 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 205 aa  208  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  49.27 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 205 aa  205  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 205 aa  205  5e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  48.78 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 205 aa  204  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 205 aa  203  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  48.29 
 
 		 206 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 205 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0701  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 204 aa  202  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 205 aa  201  4e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 205 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 205 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  46.83 
 
 		 205 aa  200  9e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 205 aa  198  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 205 aa  197  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  45.85 
 
 		 205 aa  197  7e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  47.32 
 
 		 204 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2245  30S ribosomal protein S4  48.48 
 
 		 203 aa  194  5.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892305  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0786  30S ribosomal protein S4  47.8 
 
 		 203 aa  194  9e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  0.376942 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1140  30S ribosomal protein S4  46.34 
 
 		 204 aa  193  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.768431  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  41.33 
 
 		 200 aa  154  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  41.33 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  36.55 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  36.55 
 
 		 205 aa  143  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4790  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000000781758  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4764  30S ribosomal protein S4  40.31 
 
 		 200 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0013865  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1810  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000029578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1775  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000344809  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4793  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00592592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4554  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000221474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4389  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000645812  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4399  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000278276  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4773  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4908  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0786166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3327  30S ribosomal protein S4  38.78 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000248743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4485  30S ribosomal protein S4  39.8 
 
 		 200 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.644744  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  39.29 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  39.2 
 
 		 203 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0471  30S ribosomal protein S4  39.29 
 
 		 200 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000100944  hitchhiker  4.8786299999999993e-20 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  38.76 
 
 		 207 aa  139  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1394  SSU ribosomal protein S4P  39.7 
 
 		 262 aa  137  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00631065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1284  30S ribosomal protein S4  37.76 
 
 		 200 aa  137  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000240031  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  37.56 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  38.28 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  38.28 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3782  30S ribosomal protein S4  38.28 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.034256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  38.28 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  38.58 
 
 		 203 aa  135  6.0000000000000005e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  38.28 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  37.56 
 
 		 203 aa  134  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  37.32 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3472  30S ribosomal protein S4  37.32 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  37.32 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  35.03 
 
 		 200 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  37.32 
 
 		 207 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  38.28 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  34.18 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 207 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0300  30S ribosomal protein S4  35.68 
 
 		 203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00214384  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  37.8 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  35.35 
 
 		 203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0292  30S ribosomal protein S4  37.62 
 
 		 213 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  36.84 
 
 		 207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  38.28 
 
 		 207 aa  132  5e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  37.32 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  37.32 
 
 		 207 aa  131  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>