More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0583 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0583  ribosomal protein S4  100 
 
 		 205 aa  427  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0194  30S ribosomal protein S4  56 
 
 		 202 aa  238  4e-62  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0912  30S ribosomal protein S4  55.78 
 
 		 202 aa  234  5.0000000000000005e-61  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0388  30S ribosomal protein S4  54.68 
 
 		 204 aa  228  6e-59  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2214  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 206 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2283  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.27424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0958  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 206 aa  192  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0208239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4303  30S ribosomal protein S4  44.61 
 
 		 206 aa  191  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2107  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 206 aa  190  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0954  30S ribosomal protein S4  43.14 
 
 		 206 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.86743 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2948  30S ribosomal protein S4  42.93 
 
 		 206 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0134327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0105  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4095  30S ribosomal protein S4  45.1 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1947  30S ribosomal protein S4  44.67 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.515321  normal  0.962011 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3514  30S ribosomal protein S4  43.94 
 
 		 205 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.512589  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2156  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 205 aa  185  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.508547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0416  30S ribosomal protein S4  43.63 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.338288  normal  0.0195935 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1256  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 205 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal  0.108405 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0826  30S ribosomal protein S4  44.16 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0783117  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2396  30S ribosomal protein S4  45.18 
 
 		 205 aa  182  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1270  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.450634  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1016  30S ribosomal protein S4  43.41 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0662506  normal  0.784633 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0823  30S ribosomal protein S4  45.18 
 
 		 205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1514  30S ribosomal protein S4  43.15 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1927  30S ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0830  30S ribosomal protein S4  45.18 
 
 		 205 aa  181  1e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1316  30S ribosomal protein S4  42.65 
 
 		 205 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5277  30S ribosomal protein S4  42.16 
 
 		 205 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.9692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0664  30S ribosomal protein S4  44.12 
 
 		 204 aa  177  7e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.359087  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1644  30S ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 205 aa  177  8e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2583  30S ribosomal protein S4  41.18 
 
 		 206 aa  177  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.542638  normal  0.610834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5204  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.795696  normal  0.228879 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4737  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.231394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0359  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 205 aa  175  3e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193969  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5388  30S ribosomal protein S4  39.71 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  0.936106 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0701  30S ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 204 aa  175  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1603  30S ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 205 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.176255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1740  30S ribosomal protein S4  40.69 
 
 		 205 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.31934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1777  30S ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3699  30S ribosomal protein S4  39.71 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.658744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1765  30S ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 205 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.573109  normal  0.398636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2249  30S ribosomal protein S4  40.2 
 
 		 205 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0123403  normal  0.0465366 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1140  30S ribosomal protein S4  41.67 
 
 		 204 aa  166  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.768431  normal  0.840824 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0786  30S ribosomal protein S4  43.65 
 
 		 203 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.171275  normal  0.376942 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2245  30S ribosomal protein S4  40.61 
 
 		 203 aa  158  4e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.892305  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  36.41 
 
 		 203 aa  135  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_002950  PG1912  30S ribosomal protein S4  37.56 
 
 		 201 aa  131  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  36.41 
 
 		 203 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0171  RNA-binding S4 domain-containing protein  38.3 
 
 		 200 aa  129  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.295675 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  34.36 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  35.38 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3530  30S ribosomal protein S4  38.19 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417771  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3137  30S ribosomal protein S4  36.41 
 
 		 201 aa  128  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0424686  normal  0.56438 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1815  ribosomal protein S4  36.1 
 
 		 208 aa  126  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  39.68 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12750  30S ribosomal protein S4  35.64 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.104394  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  37.11 
 
 		 208 aa  125  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0868  ribosomal protein S4  33.67 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392716  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  34.87 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1172  30S ribosomal protein S4  35.71 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0628  ribosomal protein S4  35.03 
 
 		 202 aa  124  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  33.85 
 
 		 203 aa  123  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0715  30S ribosomal protein S4  33.51 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1013  30S ribosomal protein S4  34.34 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0175272  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05845  30S ribosomal protein S4  36.46 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.16626  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5891  RNA-binding S4 domain protein  41.91 
 
 		 146 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0874  30S ribosomal protein S4  33.5 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.0803992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1018  30S ribosomal protein S4  33.5 
 
 		 205 aa  123  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000010559  normal  0.0144942 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  32.98 
 
 		 206 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0500  30S ribosomal protein S4  33.85 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000917743  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2018  30S ribosomal protein S4  35.12 
 
 		 208 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000928711 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  33.51 
 
 		 200 aa  122  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1842  SSU ribosomal protein S4P  35.2 
 
 		 203 aa  121  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  35.26 
 
 		 208 aa  121  8e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2880  ribosomal protein S4  35.96 
 
 		 205 aa  120  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04260  30S ribosomal protein S4  37.06 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.342435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  34.21 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  38.89 
 
 		 206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0176  ribosomal protein S4  36.5 
 
 		 200 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18917  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  36.32 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4369  ribosomal protein S4  35.2 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.663068  normal  0.672175 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2281  30S ribosomal protein S4  35.12 
 
 		 208 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0544941  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  38.33 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  35.79 
 
 		 208 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2137  30S ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000101892  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  38.33 
 
 		 206 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  36.93 
 
 		 211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  34.74 
 
 		 208 aa  118  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  34.21 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5761  ribosomal protein S4  33.15 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0372  30S ribosomal protein S4  32.65 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  35.32 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  38.37 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1973  30S ribosomal protein S4  33.33 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000312348  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  35 
 
 		 208 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  35.52 
 
 		 209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  35.79 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0517  30S ribosomal protein S4  38.37 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0456  30S ribosomal protein S4  38.37 
 
 		 208 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.189833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>